32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2622 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  277  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  99.26 
 
 		 136 aa  273  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  88.97 
 
 		 136 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  87.5 
 
 		 136 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.84 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  35.61 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  32.31 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  32.56 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.53 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.01 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.24 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  26.52 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.52 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  26.52 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  32.08 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  31.25 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  26.79 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  36.47 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  29.69 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  29.23 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  29.69 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1109  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.85 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1228  hypothetical protein  29.01 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  26.15 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  26.15 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  35.29 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  26.15 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  24.58 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1566  GPW/gp25 family protein  34.25 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  28.7 
 
 		 165 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  25.21 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>