27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2619 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2619  FHA domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2122  FHA domain-containing protein  99.47 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.47433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3229  FHA domain-containing protein  72.49 
 
 		 189 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1201  FHA domain-containing protein  32.6 
 
 		 503 aa  88.6  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0026  hypothetical protein  37.86 
 
 		 495 aa  86.3  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.498715  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2802  FHA domain containing protein  34.73 
 
 		 409 aa  79  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.824503  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3728  FHA domain-containing protein  34.95 
 
 		 436 aa  75.5  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1075  FHA domain containing protein  31.1 
 
 		 406 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.555961  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3250  putative FHA domain containing protein  37 
 
 		 406 aa  68.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0318  FHA domain-containing protein  27.68 
 
 		 438 aa  64.3  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0050  FHA domain-containing protein  34.29 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.824119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0391  FHA domain-containing protein  27.68 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2524  FHA domain-containing protein  26.71 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2883  FHA domain containing protein  34.58 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0993678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1106  hypothetical protein  27.91 
 
 		 428 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1225  hypothetical protein  27.91 
 
 		 428 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.980382  normal  0.728798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0241  hypothetical protein  25 
 
 		 426 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0233  hypothetical protein  25.42 
 
 		 426 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0235  hypothetical protein  24.43 
 
 		 426 aa  47.8  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3045  FHA domain containing protein  32.35 
 
 		 433 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415293  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2355  FHA domain containing protein  31.37 
 
 		 453 aa  44.7  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0100  FHA domain-containing protein  24.77 
 
 		 398 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0152  hypothetical protein  28.67 
 
 		 508 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00345793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0544  FHA domain containing protein  33.33 
 
 		 554 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1526  FHA domain-containing protein  26.67 
 
 		 398 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2092  FHA domain-containing protein  25.88 
 
 		 463 aa  42.4  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3127  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 		 409 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00194716  normal  0.0847804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>