More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2439 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3534  peroxiredoxin  100 
 
 
187 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.734574  normal  0.05332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3256  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
187 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2439  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  100 
 
 
187 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3187  peroxiredoxin  95.72 
 
 
187 aa  376  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2925  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  89.3 
 
 
187 aa  349  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333521  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2975  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  87.17 
 
 
187 aa  340  8e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.244311  normal  0.019621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3108  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  87.17 
 
 
187 aa  339  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00552107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45910  Alkyl hydroperoxide reductase  79.14 
 
 
187 aa  328  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3501  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  81.28 
 
 
187 aa  328  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1953  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  81.28 
 
 
187 aa  327  5e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0830467  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4275  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  81.28 
 
 
187 aa  327  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3432  peroxiredoxin  81.28 
 
 
187 aa  327  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4091  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  81.28 
 
 
187 aa  327  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3984  peroxiredoxin  80.75 
 
 
187 aa  326  1e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.682619  normal  0.347189 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4495  peroxiredoxin  80.75 
 
 
187 aa  325  2e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1926  alkyl hydroperoxide reductase, subunit c  81.28 
 
 
187 aa  325  2e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2045  alkyl hydroperoxide reductase protein  81.28 
 
 
187 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0667  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  81.28 
 
 
187 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.830328  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0757  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  81.28 
 
 
187 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1205  hypothetical protein  80.75 
 
 
187 aa  322  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  4.64987e-18  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0779  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  80.75 
 
 
187 aa  321  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.867109  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2046  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  80.75 
 
 
187 aa  321  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1072  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  80.75 
 
 
187 aa  321  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.62183  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1786  alkyl hydroperoxide reductase, subunit c  80.75 
 
 
187 aa  321  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.998152  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3657  peroxiredoxin  79.14 
 
 
187 aa  318  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.1316  normal  0.64975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5403  peroxiredoxin  79.68 
 
 
187 aa  316  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  1.23087e-10  normal  0.352797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2095  alkyl hydroperoxide reductase protein  78.61 
 
 
187 aa  316  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.216306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4880  peroxiredoxin  78.07 
 
 
187 aa  314  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1418  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  78.07 
 
 
187 aa  312  2e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0792  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  76.76 
 
 
189 aa  310  6e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.124423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0617  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  75.68 
 
 
189 aa  308  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.268345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1197  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  75.68 
 
 
189 aa  308  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  8.54978e-11  normal  0.901596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4717  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  77.3 
 
 
189 aa  306  1e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3325  alkyl hydroperoxide reductase/Thiol specific antioxidant/Mal allergen  75.68 
 
 
189 aa  305  2e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3222  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  75.68 
 
 
189 aa  304  4e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0801  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  75.68 
 
 
189 aa  304  4e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0958  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  75.68 
 
 
189 aa  303  1e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3044  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  75.79 
 
 
190 aa  302  2e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0829  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  74.59 
 
 
189 aa  301  3e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.520161 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0928  peroxiredoxin  75.14 
 
 
189 aa  301  5e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0522  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  73.51 
 
 
189 aa  300  7e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0896  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  75.14 
 
 
189 aa  300  8e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  74.87 
 
 
187 aa  300  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3012  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  74.05 
 
 
189 aa  300  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  74.05 
 
 
189 aa  300  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.956436  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2401  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  74.21 
 
 
190 aa  300  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.548664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2810  alkyl hydroperoxide reductase, C subunit  74.05 
 
 
188 aa  298  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  1.62826e-07 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21220  peroxiredoxin  73.26 
 
 
187 aa  297  6e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00898795  normal  0.214618 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0849  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  74.59 
 
 
205 aa  297  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3517  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  74.59 
 
 
189 aa  296  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3638  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/ Mal allergen  74.59 
 
 
189 aa  296  9e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3454  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  70.59 
 
 
187 aa  295  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3444  peroxiredoxin  74.05 
 
 
189 aa  295  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3838  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  72.19 
 
 
187 aa  293  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3927  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  70.59 
 
 
187 aa  292  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4220  peroxiredoxin  70.59 
 
 
187 aa  292  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.176986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3730  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  70.59 
 
 
187 aa  292  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04762  alkyl hydroperoxide reductase c22 protein  73.51 
 
 
185 aa  291  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3574  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  69.52 
 
 
187 aa  291  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.218003  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0705  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.98 
 
 
187 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.129921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0647  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.98 
 
 
187 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0766  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.98 
 
 
187 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.713597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0720  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.98 
 
 
187 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0661  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.98 
 
 
187 aa  291  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0626  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.91 
 
 
187 aa  289  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0519  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.91 
 
 
187 aa  289  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0657  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.91 
 
 
187 aa  289  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3038  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.91 
 
 
187 aa  289  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.783257  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0626  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.91 
 
 
187 aa  289  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00563  hypothetical protein  67.91 
 
 
187 aa  289  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.395069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00574  alkyl hydroperoxide reductase, C22 subunit  67.91 
 
 
187 aa  289  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.355104  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0691  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.91 
 
 
187 aa  289  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.759293  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3019  peroxiredoxin  67.91 
 
 
187 aa  289  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1066  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  71.35 
 
 
189 aa  289  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1145  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.98 
 
 
187 aa  289  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.731724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  71.35 
 
 
185 aa  288  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001044  alkyl hydroperoxide reductase protein C  71.89 
 
 
185 aa  286  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0317  alkyl hydroperoxide reductase  68.98 
 
 
187 aa  282  2e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01774  Peroxiredoxin  68.45 
 
 
187 aa  282  2e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0314  alkyl hydroperoxide reductase (peroxiredoxin)  68.98 
 
 
187 aa  282  2e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0330  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.98 
 
 
187 aa  282  2e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0440  alkyl hydroperoxide reductase, subunit C  68.98 
 
 
187 aa  282  2e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0345  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  68.98 
 
 
187 aa  282  2e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0439  peroxiredoxin  68.98 
 
 
187 aa  282  2e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0377  peroxiredoxin  68.98 
 
 
187 aa  282  2e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0315  peroxiredoxin  69.52 
 
 
187 aa  282  2e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00856528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0325  peroxiredoxin  68.98 
 
 
187 aa  281  3e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0392  peroxiredoxin  68.98 
 
 
187 aa  281  3e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2882  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.91 
 
 
187 aa  281  3e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000958869  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4926  peroxiredoxin  68.98 
 
 
187 aa  281  3e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2369  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.91 
 
 
187 aa  280  8e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0781  peroxiredoxin  71.66 
 
 
186 aa  280  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0408635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0942  peroxiredoxin  68.45 
 
 
187 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0869  subunit C of alkyl hydroperoxide reductase  71.66 
 
 
186 aa  279  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00649745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5072  alkyl hydroperoxide reductase subunit C  67.91 
 
 
187 aa  278  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.911201  normal  0.100881 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0447  peroxiredoxin  67.91 
 
 
187 aa  277  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3613  peroxiredoxin  66.84 
 
 
187 aa  276  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.312327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1965  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  67.38 
 
 
187 aa  276  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1242  peroxiredoxin  66.84 
 
 
187 aa  276  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03180  peroxiredoxin  64.71 
 
 
187 aa  276  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>