88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2364 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  799    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  91.62 
 
 		 382 aa  734    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  95.29 
 
 		 382 aa  765    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  98.69 
 
 		 382 aa  788    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  69.45 
 
 		 383 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  69.15 
 
 		 378 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  67.82 
 
 		 375 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  63.56 
 
 		 375 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  63.3 
 
 		 375 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  47.63 
 
 		 380 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.4 
 
 		 375 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.67 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.94 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  47.87 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.96 
 
 		 383 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  48.4 
 
 		 375 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.07 
 
 		 375 aa  364  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.44 
 
 		 378 aa  363  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  48.4 
 
 		 375 aa  363  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.61 
 
 		 375 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.61 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.61 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.61 
 
 		 375 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  47.95 
 
 		 374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  47.67 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  46.28 
 
 		 375 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  46.54 
 
 		 375 aa  353  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  45.43 
 
 		 376 aa  348  7e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  46.01 
 
 		 375 aa  347  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  45.74 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  45.48 
 
 		 375 aa  346  4e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  45.33 
 
 		 374 aa  345  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  43.98 
 
 		 381 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  43.98 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  45.33 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  44.95 
 
 		 375 aa  338  9e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  44.8 
 
 		 381 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.73 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  44.06 
 
 		 380 aa  328  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.95 
 
 		 379 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  42.51 
 
 		 384 aa  325  7e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.01 
 
 		 380 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  41.16 
 
 		 384 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  41.16 
 
 		 384 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  42.82 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.73 
 
 		 380 aa  305  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  42.47 
 
 		 384 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  42.47 
 
 		 384 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  42.19 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  42.19 
 
 		 384 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  42.19 
 
 		 384 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  41.92 
 
 		 384 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  39.58 
 
 		 388 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  42.47 
 
 		 384 aa  299  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  40.11 
 
 		 384 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  40.11 
 
 		 384 aa  298  9e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  40.11 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  40.11 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  40.11 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  40.11 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  40.11 
 
 		 384 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  43.47 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  40.77 
 
 		 384 aa  292  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  41.99 
 
 		 376 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  35.98 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.52 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0741  hypothetical protein  23.85 
 
 		 463 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.849095  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2784  hypothetical protein  25.79 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  24.27 
 
 		 393 aa  67  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.76 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  23.28 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.13 
 
 		 497 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.52 
 
 		 500 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.5 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  32.67 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  39 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  31.87 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.66 
 
 		 361 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.29 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.41 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.13 
 
 		 618 aa  44.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  23.96 
 
 		 821 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  30.16 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  29.2 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.52 
 
 		 559 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.33 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  25.31 
 
 		 586 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  28.05 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>