97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2360 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2360  spore coat U domain protein  100 
 
 
167 aa  320  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.255553  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3335  spore coat U domain-containing protein  98.2 
 
 
167 aa  314  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.416044  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1960  spore coat U domain-containing protein  93.41 
 
 
167 aa  306  1e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1800  spore coat U domain-containing protein  73.05 
 
 
167 aa  240  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3671  spore coat U  58.55 
 
 
166 aa  174  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2461  spore coat U domain-containing protein  43.75 
 
 
182 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0679  hypothetical protein  43.24 
 
 
168 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0479  hypothetical protein  43.24 
 
 
168 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1634  type I pilus protein  43.24 
 
 
168 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1397  hypothetical protein  43.24 
 
 
168 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1791  hypothetical protein  43.24 
 
 
174 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1612  spore coat protein U domain-contain protein  43.24 
 
 
174 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2679  spore coat protein U domain-contain protein  42.57 
 
 
174 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001216  CsuB  34 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.801331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4600  spore coat protein U domain-contain protein  36.53 
 
 
190 aa  82.4  3e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1666  hypothetical protein  36.26 
 
 
163 aa  81.6  4e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.607535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61500  hypothetical protein  36.81 
 
 
182 aa  82  4e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.116613 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2668  hypothetical protein  36.26 
 
 
163 aa  81.6  4e-15  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.641514  normal  0.0539014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1777  spore coat U domain-containing protein  36.69 
 
 
176 aa  81.3  5e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0475012  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2817  Spore coat U domain protein  37.2 
 
 
178 aa  81.3  6e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5297  hypothetical protein  36.11 
 
 
182 aa  80.9  8e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2110  spore coat U domain-containing protein  37.01 
 
 
184 aa  80.5  1e-14  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5299  hypothetical protein  37.84 
 
 
182 aa  79.3  2e-14  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61520  hypothetical protein  37.84 
 
 
180 aa  79  3e-14  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1797  spore coat U domain-containing protein  30 
 
 
175 aa  78.2  5e-14  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.287049 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1633  type I pilus protein  41.82 
 
 
186 aa  75.5  3e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0678  hypothetical protein  41.82 
 
 
186 aa  75.5  3e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1448  Spore coat U domain protein  37.65 
 
 
178 aa  75.9  3e-13  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1611  spore coat protein U domain-contain protein  41.82 
 
 
186 aa  75.5  3e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0480  hypothetical protein  41.82 
 
 
186 aa  75.5  3e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1790  hypothetical protein  41.82 
 
 
186 aa  75.5  3e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1396  hypothetical protein  41.82 
 
 
186 aa  75.5  3e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2680  hypothetical protein  41.21 
 
 
186 aa  74.3  7e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3674  type 1 pili protein CsuB, putative  30.86 
 
 
169 aa  73.9  1e-12  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1957  spore coat U domain-containing protein  29.38 
 
 
175 aa  73.6  1e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.144375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1776  spore coat U domain-containing protein  31.76 
 
 
185 aa  71.6  5e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0368617  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1665  hypothetical protein  32.72 
 
 
194 aa  70.1  1e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.528385  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3673  spore coat U  34.48 
 
 
177 aa  69.7  2e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2357  spore coat U domain protein  29.01 
 
 
197 aa  68.6  4e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2111  spore coat U domain-containing protein  33.12 
 
 
167 aa  68.2  5e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3338  spore coat U domain-containing protein  28.12 
 
 
197 aa  67.4  9e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2112  spore coat U domain-containing protein  34.23 
 
 
179 aa  66.2  2e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656518 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0481  hypothetical protein  36.31 
 
 
167 aa  62.8  2e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1610  hypothetical protein  37.58 
 
 
181 aa  62.8  2e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1632  type I pilus protein  37.58 
 
 
181 aa  62.4  2e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1395  hypothetical protein  36.31 
 
 
167 aa  62.8  2e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0677  hypothetical protein  36.31 
 
 
167 aa  62.8  2e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1789  hypothetical protein  37.58 
 
 
234 aa  62.4  3e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0872  hypothetical protein  37.58 
 
 
234 aa  62  4e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5298  hypothetical protein  30.06 
 
 
171 aa  60.8  7e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1798  spore coat U domain-containing protein  29.3 
 
 
178 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.280086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1267  Spore coat U domain protein  30.86 
 
 
318 aa  60.1  1e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0483759  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61510  hypothetical protein  29.45 
 
 
177 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.200762 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1778  spore coat U domain-containing protein  28.65 
 
 
184 aa  59.7  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0793064  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2681  hypothetical protein  35.03 
 
 
167 aa  59.7  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1667  hypothetical protein  28.65 
 
 
184 aa  59.7  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1958  spore coat U domain-containing protein  30.95 
 
 
178 aa  59.3  2e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141551 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0868  putative lipoprotein  31.97 
 
 
372 aa  59.3  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2358  spore coat U domain protein  30.95 
 
 
178 aa  59.3  2e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.488322 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1072  putative lipoprotein  31.45 
 
 
345 aa  58.5  4e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1224  putative lipoprotein  31.45 
 
 
336 aa  58.5  4e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0971862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1066  putative lipoprotein  31.45 
 
 
336 aa  58.5  4e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5756  secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  28.22 
 
 
333 aa  58.2  5e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0724  putative lipoprotein  31.45 
 
 
329 aa  58.2  5e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0341007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2995  putative lipoprotein  31.45 
 
 
336 aa  58.2  5e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2290  hypothetical protein  31.45 
 
 
336 aa  58.2  5e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1604  putative lipoprotein  31.45 
 
 
336 aa  58.2  5e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.957713  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3337  spore coat U domain-containing protein  30.16 
 
 
178 aa  57.8  6e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.535798  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2815  Spore coat U domain protein  27.56 
 
 
182 aa  56.2  2e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2472  spore coat U domain-containing protein  29.25 
 
 
331 aa  56.6  2e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2462  spore coat U domain-containing protein  32.4 
 
 
189 aa  56.2  2e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1449  Spore coat U domain protein  29.13 
 
 
182 aa  55.1  4e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4599  spore coat U domain-containing protein  30.97 
 
 
205 aa  55.5  4e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2338  spore coat U domain-containing protein  29.25 
 
 
331 aa  54.3  9e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156142 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0780  spore coat U domain-containing protein  30 
 
 
163 aa  53.5  1e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4394  putative secreted pili protein involved in motility and biofilm formation  31.68 
 
 
320 aa  53.9  1e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03044  lipoprotein signal peptide  34.67 
 
 
325 aa  53.9  1e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0900773  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01135  spore Coat Protein U domain family  31.03 
 
 
344 aa  53.1  2e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0663503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01138  protein U  32.1 
 
 
156 aa  53.1  2e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0616572  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4690  spore coat U domain-containing protein  29.94 
 
 
165 aa  51.2  6e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2056  putative lipoprotein  26.47 
 
 
175 aa  50.4  1e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.017923  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1959  spore coat U domain-containing protein  29.41 
 
 
177 aa  50.1  1e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.139904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2359  spore coat U domain protein  30.47 
 
 
177 aa  49.3  3e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3668  Spore coat U domain protein  36.47 
 
 
164 aa  48.5  4e-05  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3672  spore coat U  30.99 
 
 
178 aa  47.8  6e-05  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001215  CsuA  28.85 
 
 
181 aa  47.8  8e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.748118  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03041  signal peptide protein  30.12 
 
 
173 aa  47.4  9e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667718  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3336  spore coat U domain-containing protein  29.69 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1799  spore coat U domain-containing protein  30.71 
 
 
177 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.294452 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1269  Spore coat U domain protein  30 
 
 
339 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.484388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3743  Spore coat U domain protein  36.47 
 
 
164 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0306  spore coat protein, late developmental, putative  29.7 
 
 
181 aa  45.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.86749  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0538  spore coat U domain-containing protein  27.14 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.269476  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0008  spore coat protein  31.82 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0009  Spore coat U domain protein  31.82 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.164066  hitchhiker  0.00841458 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0146  spore coat U domain-containing protein  26.79 
 
 
228 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.296083  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2060  hypothetical protein  27.68 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.52918e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>