More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1977 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 493 aa  1019    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  90.47 
 
 		 493 aa  936    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  82.72 
 
 		 493 aa  869    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  90.47 
 
 		 493 aa  937    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  86.61 
 
 		 493 aa  907    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  83.13 
 
 		 494 aa  873    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  90.87 
 
 		 514 aa  940    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  99.39 
 
 		 493 aa  1015    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 		 493 aa  682    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  97.97 
 
 		 493 aa  1004    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  83.13 
 
 		 494 aa  874    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  99.59 
 
 		 493 aa  1016    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  64.99 
 
 		 493 aa  666    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  61.49 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 494 aa  632  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  60.85 
 
 		 509 aa  627  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  61.49 
 
 		 505 aa  624  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 503 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 485 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 484 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 488 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 484 aa  496  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 489 aa  465  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 506 aa  462  1e-129  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 492 aa  435  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 504 aa  433  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 500 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  39.51 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 506 aa  365  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 480 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 492 aa  365  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 484 aa  363  3e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 487 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 482 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 484 aa  350  4e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 479 aa  347  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 501 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 485 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 490 aa  342  9e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 490 aa  341  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 509 aa  339  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 500 aa  338  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 502 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 491 aa  335  7.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 488 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 516 aa  334  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 512 aa  335  2e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 490 aa  333  3e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 502 aa  333  5e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 464 aa  333  5e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 490 aa  332  7.000000000000001e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 502 aa  332  8e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 495 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 495 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 486 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 490 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 503 aa  330  4e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 502 aa  329  6e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 464 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 517 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  40.21 
 
 		 546 aa  324  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 496 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 491 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 507 aa  323  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 488 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 493 aa  322  8e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 511 aa  322  9.999999999999999e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 478 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 501 aa  320  5e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 468 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 494 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 506 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 510 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 469 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 471 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 499 aa  310  4e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 512 aa  307  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 505 aa  306  7e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 481 aa  306  8.000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>