22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1936 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  100 
 
 		 978 aa  2012    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  59.08 
 
 		 997 aa  1128    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  30.09 
 
 		 976 aa  422  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  28.75 
 
 		 749 aa  94  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  22.32 
 
 		 706 aa  90.1  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  25 
 
 		 672 aa  89  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  23.4 
 
 		 728 aa  85.5  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  27.68 
 
 		 884 aa  79  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  22.88 
 
 		 715 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  22.1 
 
 		 736 aa  72.8  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  22.89 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  21.23 
 
 		 758 aa  60.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  27.21 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  25.47 
 
 		 706 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2597  KAP P-loop domain protein  21.5 
 
 		 760 aa  57  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.207911  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  25.91 
 
 		 463 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  19.51 
 
 		 564 aa  56.6  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  21.79 
 
 		 735 aa  55.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  25.91 
 
 		 463 aa  55.8  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  20.39 
 
 		 945 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  24.03 
 
 		 623 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  20.67 
 
 		 784 aa  45.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>