More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1801 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  100 
 
 		 380 aa  775    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  84.96 
 
 		 381 aa  675    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  61.01 
 
 		 380 aa  494  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  46.44 
 
 		 381 aa  358  7e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  44.21 
 
 		 371 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  47.42 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  37.8 
 
 		 384 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  37.79 
 
 		 381 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  38.52 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  38.06 
 
 		 375 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  37.22 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 		 398 aa  212  7e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  40.88 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  39.19 
 
 		 382 aa  192  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  34.69 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  38.8 
 
 		 417 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.49 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  37.41 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  32.58 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  38.85 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  34.76 
 
 		 408 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  30.71 
 
 		 380 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  31.37 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  36.8 
 
 		 393 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  37.17 
 
 		 371 aa  175  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 375 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  39.01 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 381 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 385 aa  170  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  39.13 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.2 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.46 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  33.69 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 		 434 aa  166  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 370 aa  166  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  39.41 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 		 373 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 420 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  37.67 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 395 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  30.86 
 
 		 351 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  34.89 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 		 384 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  29.84 
 
 		 378 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 		 374 aa  146  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  32.27 
 
 		 381 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  34.77 
 
 		 1089 aa  143  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2776  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 418 aa  142  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 394 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  34.1 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  27.79 
 
 		 1219 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  32.41 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  37.71 
 
 		 364 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  32.51 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  32.51 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 		 376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 		 535 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  27.76 
 
 		 374 aa  136  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 340 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  26.08 
 
 		 381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  33.7 
 
 		 1028 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  34.49 
 
 		 394 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1035  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 366 aa  133  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.788925  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  32.88 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 		 361 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 		 346 aa  133  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  30.14 
 
 		 419 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  29.47 
 
 		 859 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  25 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 860 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 		 1241 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  31.88 
 
 		 1241 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.63 
 
 		 815 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6340  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 524 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 358 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>