98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1790 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1790  acylneuraminate cytidylyltransferase, putative  100 
 
 		 231 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1594  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.59 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4769  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.41 
 
 		 224 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0292  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.09 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0054  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.51 
 
 		 231 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0052  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.51 
 
 		 231 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0163138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0292  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  30.09 
 
 		 225 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2838  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.63 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0478291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1883  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.74 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4941  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  29.69 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001797  N-Acetylneuraminate cytidylyltransferase  27.71 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00677  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  28.14 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0722  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  24.78 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2217  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  25.66 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.454172  normal  0.965631 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14211  hypothetical protein  28.38 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07300  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.55 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12871  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  27.43 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0341176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0009  putative transferase  22.41 
 
 		 383 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.848658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2336  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  27.71 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.177119  normal  0.565326 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1387  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.63 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.661123  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.87 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0406  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.78 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1506  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.43 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0462  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  24 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0975  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.27 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  24.2 
 
 		 468 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3009  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.19 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0559  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.12 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1581  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.84 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3030  pseudaminic acid CMP-transferase  35.14 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3400  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.72 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0656  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  30.99 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0382756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3094  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.89 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0307  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.11 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.245282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02898  putative Acylneuraminate cytidylyltransferase  26.2 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00719916  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1278  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  22.32 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1309  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.54 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.774986 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0052  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.53 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3125  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  27 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2981  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  27 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0478934  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36315  predicted protein  25.11 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412907  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2210  pseudaminic acid CMP-transferase  27.95 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1549  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.45 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1288  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.42 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1484  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.26 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.51038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0634  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  25.45 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.684247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2094  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  24.17 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1521  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.92 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2424  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.77 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.352723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3550  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.31 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.271433 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0087  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.31 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.770014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3941  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.24 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0582629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2414  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.41 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150981 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0417  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.64 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2324  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.95 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4089  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.37 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.69 
 
 		 548 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0562  hypothetical protein  29.03 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1161  CMP-Neu5Ac synthetase  28.69 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  27.71 
 
 		 672 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08741  hypothetical protein  25.11 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149223 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1158  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase NeuA  24.44 
 
 		 413 aa  51.6  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3231  polysialic acid capsule biosynthesis N-acylneuraminate cytidylyltransferase NeuA  22.65 
 
 		 418 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1514  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.73 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3078  acylneuraminate cytidylyltransferase  30 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3257  CMP-N-acetlyneuraminic acid synthetase  23.93 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3709  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  23.83 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2761  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  25.21 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.387843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1132  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.95 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0620  pseudaminic acid CMP-transferase  24.81 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0424075  hitchhiker  0.00180398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3365  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  25.51 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0844  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.63 
 
 		 423 aa  48.5  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0443  acylneuraminate cytidylyltransferase  30 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0021  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.37 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1536  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.49 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0758  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.71 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0788  CMP-N-acetlyneuraminic acid synthetase  24.46 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0817  CMP-N-acetlyneuraminic acid synthetase  24.46 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2627  acylneuraminate cytidylyltransferase  25 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3562  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.53 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.298178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1387  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.44 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00882869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2397  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.76 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520098  normal  0.461762 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  22.52 
 
 		 439 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13063  putative NeuA  36.67 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0169  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  20.36 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.719542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1578  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.79 
 
 		 230 aa  45.8  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1024  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.55 
 
 		 229 aa  45.1  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1467  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  23.75 
 
 		 239 aa  45.1  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1455  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.78 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0148  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.28 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4264  pseudaminic acid CMP-transferase  22.61 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1844  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.26 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1585  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.81 
 
 		 238 aa  42.7  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4332  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.23 
 
 		 221 aa  42  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1636  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  22.68 
 
 		 254 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0412852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2141  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  22.9 
 
 		 248 aa  42  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12421  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  30 
 
 		 243 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0134471 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0706  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  29.73 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>