More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1780 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  100 
 
 		 1635 aa  3357    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 		 1241 aa  365  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 		 1261 aa  350  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 1233 aa  346  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  46.22 
 
 		 815 aa  335  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 		 1398 aa  332  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 		 1243 aa  324  8e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  45.29 
 
 		 1241 aa  320  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0920  glycosyl transferase, group 1  43.04 
 
 		 831 aa  313  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  53.7 
 
 		 646 aa  311  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  28.65 
 
 		 1219 aa  302  3e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  43.27 
 
 		 838 aa  303  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1232 aa  298  7e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  43.48 
 
 		 846 aa  297  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  43.48 
 
 		 846 aa  297  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  34.79 
 
 		 1229 aa  297  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  33.84 
 
 		 850 aa  295  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2979  WbbD domain protein  61.63 
 
 		 272 aa  292  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2594  Methyltransferase type 11  61.63 
 
 		 272 aa  292  4e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  43.19 
 
 		 442 aa  278  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  51.33 
 
 		 396 aa  276  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  54.32 
 
 		 436 aa  273  1e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 1915 aa  269  4e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  43.57 
 
 		 442 aa  265  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1334  glycosyltransferase, putative  38.82 
 
 		 431 aa  253  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218572  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  36.69 
 
 		 860 aa  246  3e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  36.95 
 
 		 859 aa  241  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  31.99 
 
 		 1332 aa  239  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71930  glycosyltransferase WbpX  40.58 
 
 		 460 aa  213  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  36.48 
 
 		 967 aa  213  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  42.11 
 
 		 306 aa  211  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6239  glycosyltransferase WbpX  40.26 
 
 		 460 aa  208  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5686  glycosyl transferase, group 1  36.86 
 
 		 455 aa  189  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101413  normal  0.632336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  40 
 
 		 477 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  39.69 
 
 		 351 aa  150  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  33.04 
 
 		 373 aa  145  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  26.88 
 
 		 743 aa  129  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  42.86 
 
 		 376 aa  126  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1733  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 384 aa  122  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5069  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 		 434 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750506  normal  0.0356262 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1976  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 541 aa  115  6e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0537449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5364  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 432 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0643  glycosyl transferase group 1  33.48 
 
 		 413 aa  113  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.984184 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5026  glycosyl transferase group 1  32.13 
 
 		 459 aa  113  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1230  hypothetical protein  30.59 
 
 		 417 aa  112  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643634  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2590  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 389 aa  110  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.998711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2976  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 		 389 aa  110  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  40.34 
 
 		 616 aa  107  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4974  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 456 aa  106  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 		 374 aa  106  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4511  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 456 aa  106  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 357 aa  105  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  34.73 
 
 		 377 aa  103  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 		 624 aa  102  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2434  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 		 426 aa  100  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1162  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 384 aa  99.8  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.020878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 		 679 aa  99.4  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 		 380 aa  99.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1326  glycosyltransferase, putative  30.24 
 
 		 383 aa  98.6  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 359 aa  97.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6411  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 435 aa  97.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 434 aa  97.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8689  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 		 435 aa  97.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0739  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 383 aa  96.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 437 aa  96.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0372  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1085 aa  96.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.25 
 
 		 372 aa  96.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3302  WcbB  26.25 
 
 		 383 aa  96.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.25 
 
 		 372 aa  96.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2308  glycosyltransferase, putative  25.87 
 
 		 383 aa  94.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.865333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2186  putative glycosyltransferase  25.87 
 
 		 383 aa  94.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1534  glycosyl transferase group 1  28.47 
 
 		 388 aa  95.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0520  putative glycosyltransferase  25.87 
 
 		 383 aa  94.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.326748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1079  putative glycosyltransferase  25.87 
 
 		 383 aa  94.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.256775  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0770  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 		 399 aa  94.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0854  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 494 aa  93.2  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3858  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 321 aa  92  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 		 435 aa  91.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 		 359 aa  90.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2295  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 		 412 aa  90.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.380309  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 382 aa  89.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2119  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 420 aa  89  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0632513  normal  0.128982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2081  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 817 aa  88.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 366 aa  87.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0219  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 378 aa  84.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4924  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 		 386 aa  84  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0745  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 		 426 aa  83.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5391  glycosyl transferase group 1  37.41 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.919124 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0734  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 471 aa  80.5  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  27.16 
 
 		 372 aa  79.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4016  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1615  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase WcbB, putative  24.89 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.921217  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2084  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 		 420 aa  78.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2303  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.46 
 
 		 507 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.500428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2181  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.46 
 
 		 507 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0525  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.46 
 
 		 507 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.317265  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1074  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.46 
 
 		 507 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.109997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>