92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1759 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  97.49 
 
 		 210 aa  363  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  86.43 
 
 		 210 aa  348  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  94.97 
 
 		 210 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  70.85 
 
 		 211 aa  285  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  68.37 
 
 		 200 aa  261  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  68.84 
 
 		 210 aa  256  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  68.34 
 
 		 210 aa  254  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  66.84 
 
 		 212 aa  246  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  64.82 
 
 		 210 aa  241  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  63.82 
 
 		 199 aa  240  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  45.92 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  45.99 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  39.8 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  43.98 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  43.46 
 
 		 221 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  44.5 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  37.88 
 
 		 259 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  33.85 
 
 		 200 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  33.85 
 
 		 238 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  32.34 
 
 		 223 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  33.85 
 
 		 242 aa  118  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  36.82 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  35.35 
 
 		 210 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  34.5 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  34.83 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  29.35 
 
 		 242 aa  86.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  35.64 
 
 		 233 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  36.96 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  30.43 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  34.95 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  27.72 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  28.19 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  32.26 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  34.04 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  25.41 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  32.8 
 
 		 231 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  31.28 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  31.43 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  25.99 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  31.75 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  33.87 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  32.24 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  29.41 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  26.34 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  29.26 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  28.25 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  31.72 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  23.98 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  28.25 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  26.21 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  26.04 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  31.15 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  27.68 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  21.81 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  23.04 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  28 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  22.78 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  22.22 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  31.5 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  28.57 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  23.35 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  30.65 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  24.86 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 		 303 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  22.81 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  28.72 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  28.72 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  30.6 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  28.72 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  22.94 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  30.14 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.58 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  22.92 
 
 		 319 aa  45.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  33.61 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  33.61 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  33.61 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  21.35 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  33.61 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  33.61 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  33.61 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  26.97 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  25.53 
 
 		 221 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  23.84 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  20.74 
 
 		 328 aa  41.2  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>