252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1758 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  98.06 
 
 		 310 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  96.13 
 
 		 310 aa  630  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  95.16 
 
 		 310 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  86.32 
 
 		 313 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  86.64 
 
 		 317 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  85.02 
 
 		 317 aa  564  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  84.16 
 
 		 312 aa  548  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  84.33 
 
 		 312 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  84 
 
 		 312 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  77.26 
 
 		 314 aa  499  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  66.89 
 
 		 331 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  66.55 
 
 		 323 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  66.33 
 
 		 326 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  66.55 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  66.55 
 
 		 333 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  66.55 
 
 		 330 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  65.54 
 
 		 309 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  66.67 
 
 		 323 aa  424  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  65.2 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  65.2 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  64.86 
 
 		 334 aa  421  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  65.88 
 
 		 333 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  65.88 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  64.21 
 
 		 336 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  63.39 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  64.03 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  65.2 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  64.33 
 
 		 326 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  64.19 
 
 		 350 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  64.53 
 
 		 327 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  63.21 
 
 		 337 aa  411  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  64 
 
 		 332 aa  411  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  62.25 
 
 		 341 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  62 
 
 		 352 aa  408  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  63.67 
 
 		 332 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  62 
 
 		 352 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  64.33 
 
 		 326 aa  409  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  64.03 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  62.71 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  62.38 
 
 		 326 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  62.76 
 
 		 306 aa  396  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  59.39 
 
 		 305 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  59.53 
 
 		 309 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  58.28 
 
 		 294 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  59.26 
 
 		 314 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  58.67 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  57.04 
 
 		 304 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  57.39 
 
 		 302 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  59.12 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  54.85 
 
 		 305 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  55.18 
 
 		 305 aa  349  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  55.18 
 
 		 308 aa  349  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  53.67 
 
 		 319 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  51.64 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  52.63 
 
 		 316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  53.85 
 
 		 305 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  55.05 
 
 		 322 aa  342  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  56.01 
 
 		 299 aa  337  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  52.96 
 
 		 317 aa  337  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  54.24 
 
 		 301 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  50.83 
 
 		 322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  51.35 
 
 		 311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  50.82 
 
 		 555 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  54.39 
 
 		 313 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  49.67 
 
 		 327 aa  301  7.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  49.5 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  58.58 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  47.67 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  45.36 
 
 		 320 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  57.38 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  47.77 
 
 		 310 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  52.38 
 
 		 255 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  43.64 
 
 		 319 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  53.22 
 
 		 254 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  54.01 
 
 		 255 aa  276  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  53.22 
 
 		 254 aa  272  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  42.96 
 
 		 319 aa  272  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  53.19 
 
 		 242 aa  265  5.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11851  sulfurtransferase  41.41 
 
 		 310 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.403922  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  43.84 
 
 		 269 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  46.88 
 
 		 275 aa  249  5e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2009  rhodanese superfamily protein  47.72 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal  0.757941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2404  rhodanese superfamily protein  47.02 
 
 		 287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12011  sulfurtransferase  38.72 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.303044  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1105  rhodanese-like protein  39.06 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2206  rhodanese superfamily protein  46.91 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12001  sulfurtransferase  39.46 
 
 		 310 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.982527  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0206  rhodanese-like protein  42.28 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2535  rhodanese superfamily protein  46.52 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574303  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  42.05 
 
 		 623 aa  227  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0753  rhodanese superfamily protein  43.93 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0896  rhodanese domain-containing protein  42.53 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.259251  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  44.02 
 
 		 302 aa  222  8e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26565  predicted protein  41.31 
 
 		 346 aa  218  7e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460392  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1702  rhodanese superfamily protein  40.78 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2314  rhodanese superfamily protein  40.78 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2337  rhodanese superfamily protein  41.09 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.933613  normal  0.0128371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  41.37 
 
 		 287 aa  205  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1252  rhodanese superfamily protein  42.09 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>