59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1740 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  88.1 
 
 		 521 aa  852    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  100 
 
 		 525 aa  1051    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  93.44 
 
 		 522 aa  846    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  69.13 
 
 		 533 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  98.85 
 
 		 521 aa  1028    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  70.75 
 
 		 531 aa  736    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  42.31 
 
 		 638 aa  363  4e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  41.35 
 
 		 650 aa  362  1e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  40.15 
 
 		 558 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  40.98 
 
 		 558 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  40.87 
 
 		 532 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  41.74 
 
 		 541 aa  312  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  39.16 
 
 		 535 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  37.15 
 
 		 538 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  41.6 
 
 		 494 aa  299  9e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  38 
 
 		 536 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  54.35 
 
 		 540 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  48.78 
 
 		 541 aa  294  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  37.58 
 
 		 529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  41.01 
 
 		 903 aa  239  9e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  41.42 
 
 		 869 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  39.63 
 
 		 905 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 		 862 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  39.14 
 
 		 863 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  38.84 
 
 		 863 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  39.14 
 
 		 863 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  39.94 
 
 		 885 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 		 895 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  38.15 
 
 		 899 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  37.87 
 
 		 889 aa  199  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  38.61 
 
 		 863 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  41.02 
 
 		 919 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 		 889 aa  196  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  38.08 
 
 		 895 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 944 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  36.15 
 
 		 868 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 		 917 aa  182  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  36.68 
 
 		 859 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  34.72 
 
 		 844 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 		 831 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 889 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.09 
 
 		 842 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  31 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 295 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03727  putative beta transglucosylase, GH17 family (Eurofung)  25.56 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74722  Glycoside hydrolase, family 17  26.92 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154228  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  28.17 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  26.18 
 
 		 336 aa  73.2  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  24.28 
 
 		 555 aa  72  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  25.26 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0507  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  27.52 
 
 		 338 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  23.26 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32120  family 17 glucosidase SCW11 precursor (Soluble cell wall protein 11)  24.22 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.506951  normal  0.0756506 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89695  Soluble Cell Wall protein  23.51 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00660  glucan 1,3 beta-glucosidase protein putative  26.7 
 
 		 249 aa  63.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01551  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BD29]  23.51 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.550208  normal  0.0387764 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07950  Beta-1,3-endoglucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUT0]  26.92 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000158341  normal  0.358394 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  25.98 
 
 		 649 aa  56.6  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.3 
 
 		 1290 aa  50.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>