More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1719 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1321  carboxyl-terminal protease  75.36 
 
 
704 aa  1115  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.184977  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1268  carboxyl-terminal protease  97.4 
 
 
693 aa  1378  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000748265  normal  0.0247488 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1599  peptidase S41A, C-terminal protease  84.94 
 
 
704 aa  1238  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0464892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3885  tail-specific protease  85.71 
 
 
693 aa  1234  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4000  carboxyl-terminal protease  99.43 
 
 
704 aa  1428  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00109251  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35170  C-terminal peptidase, S41A subfamily  77.49 
 
 
693 aa  1119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.422257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  48.21 
 
 
721 aa  670  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1679  C-terminal processing peptidase-1  87.66 
 
 
705 aa  1276  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054588  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1868  periplasmic tail-specific protease  76.65 
 
 
699 aa  1112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.435516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1719  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
704 aa  1432  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0889073  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21880  periplasmic tail-specific protease  77.62 
 
 
698 aa  1117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0932853  hitchhiker  6.29787e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1311  carboxyl-terminal protease  97.98 
 
 
693 aa  1386  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.299557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1994  C-terminal processing peptidase-1  48.42 
 
 
703 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.754178  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2885  carboxyl-terminal protease  46.09 
 
 
698 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000352387  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1519  C-terminal processing peptidase-1  47.42 
 
 
698 aa  607  1e-172  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0166  carboxyl-terminal protease  42.07 
 
 
726 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1593  C-terminal processing peptidase-1  44.95 
 
 
708 aa  547  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4634  carboxyl-terminal protease  42.47 
 
 
709 aa  537  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0425581  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6521  carboxyl-terminal protease  42.42 
 
 
709 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  42.97 
 
 
665 aa  525  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.53479e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003431  tail-specific protease precursor  44.24 
 
 
668 aa  525  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00461835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1993  carboxy-terminal protease  43.62 
 
 
679 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  9.30411e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2483  carboxy-terminal protease  43.83 
 
 
690 aa  518  1e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  1.06803e-05  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1802  carboxy-terminal protease  42.65 
 
 
681 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.308146  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2228  carboxy-terminal protease  43.09 
 
 
683 aa  509  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.128038  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1046  carboxyl-terminal protease  45.41 
 
 
693 aa  511  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  1.42201e-07  unclonable  1.92026e-06 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  43.03 
 
 
664 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1722  carboxy-terminal protease  43.68 
 
 
683 aa  509  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.52033e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3441  carboxyl-terminal protease  43.34 
 
 
725 aa  506  1e-142  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0836072  normal  0.132534 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1544  carboxy-terminal protease  43.62 
 
 
672 aa  508  1e-142  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2560  carboxy-terminal protease  43.22 
 
 
681 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.21905  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1022  peptidase S41A, C-terminal protease  42.68 
 
 
707 aa  501  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  4.00969e-06  normal  0.0227897 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5403  carboxyl-terminal protease  44.65 
 
 
705 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2447  carboxy-terminal protease  43.22 
 
 
681 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2133  carboxy-terminal protease  43.46 
 
 
690 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  7.55516e-06  normal  0.0766103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2440  carboxy-terminal protease  43.22 
 
 
681 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1106  carboxyl-terminal protease  43.01 
 
 
727 aa  500  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4122  carboxyl-terminal protease  42.4 
 
 
697 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2601  carboxy-terminal protease  42 
 
 
682 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1200  C-terminal processing peptidase  43.01 
 
 
727 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1778  carboxy-terminal protease  43.18 
 
 
683 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0159186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1585  carboxy-terminal protease  40.94 
 
 
681 aa  498  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00663256  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01789  hypothetical protein  42.9 
 
 
682 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5898  carboxyl-terminal protease  43.51 
 
 
705 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1802  carboxy-terminal protease  42.9 
 
 
682 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0594829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1904  carboxy-terminal protease  43.07 
 
 
681 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.239407  normal  0.209201 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1304  C-terminal processing peptidase-1  44.18 
 
 
680 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01801  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  42.9 
 
 
682 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1845  carboxy-terminal protease  41.81 
 
 
673 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04290  tail-specific protease  43.38 
 
 
719 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1921  carboxy-terminal protease  42.9 
 
 
682 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.49225e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2098  carboxy-terminal protease  42.9 
 
 
682 aa  497  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.92203e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2810  carboxy-terminal protease  40.37 
 
 
683 aa  493  1e-138  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2059  carboxy-terminal protease  42.75 
 
 
682 aa  495  1e-138  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.8938e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1357  carboxy-terminal protease  42.94 
 
 
680 aa  495  1e-138  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.34708e-06  normal  0.174046 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1812  carboxyl-terminal protease  42.75 
 
 
682 aa  495  1e-138  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1748  carboxy-terminal protease  42.73 
 
 
683 aa  495  1e-138  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0158568  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1673  carboxy-terminal protease  42.73 
 
 
683 aa  495  1e-138  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274964  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1470  carboxy-terminal protease  43.59 
 
 
682 aa  493  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0690257  normal  0.257685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2563  carboxy-terminal protease  42.94 
 
 
680 aa  494  1e-138  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.6056e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  43.8 
 
 
678 aa  493  1e-138  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.59277e-05  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1935  carboxy-terminal protease  41.1 
 
 
681 aa  494  1e-138  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.487036  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2046  carboxy-terminal protease  43.29 
 
 
682 aa  493  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1988  carboxy-terminal protease  43.59 
 
 
698 aa  493  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547675  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1286  carboxy-terminal protease  43.59 
 
 
682 aa  493  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.8564e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  41.95 
 
 
671 aa  495  1e-138  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1984  carboxy-terminal protease  43.74 
 
 
682 aa  495  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00711922  hitchhiker  0.00523275 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1328  C-terminal processing peptidase-1  43.81 
 
 
694 aa  489  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0242336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1672  carboxy-terminal protease  42.84 
 
 
690 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.04013e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0729  peptidase S41A, C-terminal protease  43.26 
 
 
683 aa  490  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1783  carboxy-terminal protease  42.84 
 
 
692 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00680502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2146  C-terminal processing peptidase-1  41.84 
 
 
712 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.19614 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2663  carboxy-terminal protease  42.84 
 
 
689 aa  487  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.97932e-06  hitchhiker  0.0063771 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2141  carboxy-terminal protease  41.05 
 
 
671 aa  488  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  41.95 
 
 
664 aa  483  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2202  carboxy-terminal protease  40.8 
 
 
681 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.846279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2074  carboxy-terminal protease  40.8 
 
 
673 aa  483  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  42.01 
 
 
680 aa  482  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1252  carboxyl-terminal protease  41.57 
 
 
697 aa  479  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2400  carboxy-terminal protease  42.45 
 
 
682 aa  479  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1363  carboxyl-terminal protease  42.23 
 
 
688 aa  476  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1217  carboxyl-terminal protease  42.76 
 
 
674 aa  473  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1366  carboxyl-terminal protease  41.99 
 
 
687 aa  475  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1326  carboxyl-terminal protease  42.45 
 
 
674 aa  466  1e-130  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.91473  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1071  carboxy-terminal protease  41.19 
 
 
675 aa  461  1e-128  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.461658  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0121  carboxyl-terminal protease  39 
 
 
706 aa  458  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1152  carboxyl-terminal protease  38.35 
 
 
683 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0282  C-terminal processing peptidase-1  34.59 
 
 
737 aa  398  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610921  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0315  carboxyl-terminal protease  34.4 
 
 
735 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  1.44056e-06  hitchhiker  2.88236e-05 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0309  carboxyl-terminal protease  34.59 
 
 
737 aa  392  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0982282  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0003  carboxyl-terminal protease  38.2 
 
 
702 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3496  carboxyl-terminal protease  35.19 
 
 
743 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.847425  normal  0.281142 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1631  carboxyl-terminal protease  34.12 
 
 
748 aa  352  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04840  probable periplasmic tail-specific proteinase  35.79 
 
 
706 aa  350  6e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1430  carboxyl-terminal protease  34 
 
 
727 aa  349  9e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1658  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  36.55 
 
 
719 aa  327  4e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.05852e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1953  carboxyl-terminal protease  33.38 
 
 
711 aa  303  6e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2561  C-terminal processing peptidase  30.02 
 
 
676 aa  240  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0632  C-terminal processing peptidase-1  32.89 
 
 
705 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_002620  TC0725  tail specific protease precursor, putative  33.25 
 
 
649 aa  177  8e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>