More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1684 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  780    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  95.24 
 
 		 400 aa  708    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1242  major facilitator transporter  92.23 
 
 		 400 aa  638    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.346574  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  98.75 
 
 		 400 aa  749    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  84.42 
 
 		 402 aa  618  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  84.42 
 
 		 402 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1652  major facilitator transporter  84.46 
 
 		 402 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  81.06 
 
 		 402 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47560  putative MFS transporter  82.86 
 
 		 399 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.973553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4104  MFS family transporter  82.14 
 
 		 399 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1761  major facilitator transporter  79.35 
 
 		 401 aa  535  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0133349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3111  major facilitator superfamily MFS_1  60.8 
 
 		 408 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3004  major facilitator superfamily MFS_1  60.57 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  53.4 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2920  major facilitator transporter  59.84 
 
 		 410 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  53.77 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  53.35 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  52.81 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  53.05 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0898  major facilitator transporter  50.38 
 
 		 410 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  51.37 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  53.05 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  52.17 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  53.94 
 
 		 405 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  52.84 
 
 		 413 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 407 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  52.33 
 
 		 408 aa  362  7.0000000000000005e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05284  hypothetical protein  47.61 
 
 		 404 aa  352  5e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  43.9 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  48.87 
 
 		 436 aa  349  4e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  52.56 
 
 		 430 aa  346  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  46.95 
 
 		 414 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2279  major facilitator transporter  45.82 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  48.06 
 
 		 406 aa  342  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1369  major facilitator transporter  46.46 
 
 		 417 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  48.24 
 
 		 480 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 412 aa  328  8e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1093  major facilitator transporter  48.69 
 
 		 410 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  48.69 
 
 		 410 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  48.69 
 
 		 410 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0698  major facilitator transporter  47.42 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.733103  normal  0.933566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 410 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  47.27 
 
 		 528 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1328  major facilitator superfamily MFS_1  52.07 
 
 		 405 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 410 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1392  major facilitator superfamily MFS_1  52.2 
 
 		 405 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4676  major facilitator superfamily MFS_1  47.29 
 
 		 416 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2293  major facilitator family transporter  48.83 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3057  major facilitator family transporter  48.83 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3184  major facilitator family transporter  48.83 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2004  hypothetical protein  48.83 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1401  oxalate/formate antiporter  48.83 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0951  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1027  major facilitator family transporter  48.83 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.492633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1314  major facilitator family transporter  48.83 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3739  major facilitator transporter  43.88 
 
 		 413 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.101854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0703  major facilitator transporter  45.37 
 
 		 409 aa  296  6e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 411 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1889  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 		 411 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 411 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2047  major facilitator superfamily transporter  40.89 
 
 		 421 aa  292  9e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.341858  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0716  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.449869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 414 aa  289  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0030  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 412 aa  278  9e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1372  major facilitator transporter  40.39 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2770  major facilitator transporter  39.8 
 
 		 414 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.824791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0040  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 415 aa  256  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0111  transmembrane transporter  37.81 
 
 		 411 aa  252  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 415 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1698  major facilitator transporter  42.25 
 
 		 427 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.418951  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2977  major facilitator superfamily transporter  42.35 
 
 		 412 aa  240  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.719308  normal  0.188598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3581  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 405 aa  239  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0314  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2922  transmembrane transport protein  40.69 
 
 		 421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1682  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 411 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1797  major facilitator transporter  36.03 
 
 		 389 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  33.1 
 
 		 442 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 428 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  30.36 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  30.53 
 
 		 430 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 438 aa  143  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 433 aa  140  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3695  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 437 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  30.64 
 
 		 435 aa  139  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  31.28 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3053  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0592542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1057  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 436 aa  133  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  29.32 
 
 		 430 aa  132  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>