28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1682 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1682  glycosy hydrolase family protein  100 
 
 		 434 aa  883    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4037  glycoside hydrolase family protein  98.47 
 
 		 393 aa  790    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1163  glycoside hydrolase family 5  57.95 
 
 		 395 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1758  glycoside hydrolase family 5  50.93 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0013605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1694  glycosidase, family 5  38.7 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000120172 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3539  glycosidase, family 5  38.9 
 
 		 422 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  24.48 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  26.67 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 357 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0182  glycoside hydrolase family protein  25.15 
 
 		 373 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  26.52 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  31.65 
 
 		 601 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  24.89 
 
 		 489 aa  53.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  28.25 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3417  twin-arginine translocation pathway signal  30.29 
 
 		 831 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4460  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 		 814 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  25.1 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  22.64 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1727  endoglucanase  27.78 
 
 		 588 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.296134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  30.22 
 
 		 573 aa  46.6  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1682  hypothetical protein  27.23 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446852  normal  0.0463851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  25.35 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0669  Cellulase  22.96 
 
 		 332 aa  43.9  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  22.34 
 
 		 481 aa  43.9  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  32.91 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  25.78 
 
 		 863 aa  43.5  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>