147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1450 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  100 
 
 		 565 aa  1127    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  69.11 
 
 		 559 aa  763    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  95.71 
 
 		 560 aa  1069    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  45.09 
 
 		 575 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  47.97 
 
 		 570 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  34.91 
 
 		 558 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  31.2 
 
 		 562 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  31.55 
 
 		 565 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  31.55 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  30.82 
 
 		 562 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  30.82 
 
 		 562 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  32.12 
 
 		 570 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.38 
 
 		 585 aa  179  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  30.07 
 
 		 569 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.71 
 
 		 573 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.9 
 
 		 560 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.94 
 
 		 565 aa  154  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  28.79 
 
 		 568 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  28.79 
 
 		 585 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  29.4 
 
 		 561 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.47 
 
 		 595 aa  150  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.03 
 
 		 584 aa  149  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  28.57 
 
 		 585 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  28.6 
 
 		 578 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.29 
 
 		 586 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.28 
 
 		 553 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.25 
 
 		 608 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.49 
 
 		 593 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.8 
 
 		 594 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  26.62 
 
 		 586 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  26.62 
 
 		 586 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.8 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  25.87 
 
 		 553 aa  139  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  29.09 
 
 		 588 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  28.9 
 
 		 590 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.08 
 
 		 513 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.23 
 
 		 557 aa  136  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  28.94 
 
 		 590 aa  135  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  27.39 
 
 		 582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.41 
 
 		 554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.08 
 
 		 575 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  27.62 
 
 		 584 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.16 
 
 		 554 aa  130  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.21 
 
 		 558 aa  128  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  27.02 
 
 		 584 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  22.51 
 
 		 539 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  26 
 
 		 583 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  27.57 
 
 		 583 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.48 
 
 		 550 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  27.07 
 
 		 562 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.07 
 
 		 562 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  26.94 
 
 		 602 aa  114  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  28.86 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  28.86 
 
 		 558 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  28.86 
 
 		 554 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  28.86 
 
 		 558 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  28.86 
 
 		 551 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.16 
 
 		 568 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.57 
 
 		 562 aa  107  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.56 
 
 		 585 aa  106  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.88 
 
 		 562 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  28.99 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.7 
 
 		 562 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.71 
 
 		 580 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  24.27 
 
 		 570 aa  104  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.87 
 
 		 610 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  28.25 
 
 		 554 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.23 
 
 		 591 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.38 
 
 		 591 aa  102  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.23 
 
 		 591 aa  101  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.95 
 
 		 592 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.16 
 
 		 592 aa  100  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.34 
 
 		 580 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.16 
 
 		 581 aa  97.8  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.57 
 
 		 582 aa  97.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.94 
 
 		 563 aa  96.7  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.38 
 
 		 567 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.61 
 
 		 581 aa  95.1  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  22.1 
 
 		 547 aa  94.7  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.47 
 
 		 597 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.68 
 
 		 574 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.08 
 
 		 556 aa  92  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  24.51 
 
 		 581 aa  91.3  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  23.76 
 
 		 578 aa  89.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.15 
 
 		 568 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  24.79 
 
 		 574 aa  88.2  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.95 
 
 		 587 aa  88.2  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.95 
 
 		 570 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  21.6 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  22.27 
 
 		 590 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  24.15 
 
 		 564 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  21.67 
 
 		 590 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.43 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.52 
 
 		 563 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.6 
 
 		 585 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  23.46 
 
 		 572 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.22 
 
 		 593 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.22 
 
 		 572 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.06 
 
 		 583 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  26.09 
 
 		 553 aa  68.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>