More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1407 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  100 
 
 		 568 aa  1122    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  99.47 
 
 		 568 aa  1117    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  97.71 
 
 		 568 aa  1074    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  63.2 
 
 		 578 aa  713    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  64.35 
 
 		 573 aa  697    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  45.23 
 
 		 585 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  45.42 
 
 		 590 aa  432  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  44.49 
 
 		 585 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  44.49 
 
 		 585 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  44.49 
 
 		 585 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  45.39 
 
 		 585 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  45.39 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  44.49 
 
 		 585 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  45.01 
 
 		 585 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  44.34 
 
 		 591 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  44.15 
 
 		 576 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  40.26 
 
 		 560 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  45.21 
 
 		 592 aa  405  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  42.59 
 
 		 567 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  46.18 
 
 		 569 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  39.21 
 
 		 574 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  42.75 
 
 		 600 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  42.02 
 
 		 579 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  42.02 
 
 		 579 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  43.77 
 
 		 578 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  43.97 
 
 		 592 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  37.79 
 
 		 580 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  38.11 
 
 		 565 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  38.53 
 
 		 575 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  37.86 
 
 		 573 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  37.68 
 
 		 596 aa  364  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  38.98 
 
 		 595 aa  361  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  37.86 
 
 		 570 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  39 
 
 		 566 aa  355  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  37.75 
 
 		 583 aa  352  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  37.5 
 
 		 570 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  37.68 
 
 		 570 aa  349  8e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  35.87 
 
 		 575 aa  345  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  37.21 
 
 		 579 aa  342  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  38.83 
 
 		 559 aa  342  8e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  39.31 
 
 		 590 aa  342  8e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  38.42 
 
 		 574 aa  334  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  35.93 
 
 		 586 aa  333  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  35.71 
 
 		 576 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  36.05 
 
 		 582 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  37.5 
 
 		 592 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  37.93 
 
 		 569 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  37.32 
 
 		 590 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  36.05 
 
 		 572 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  36.49 
 
 		 587 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  36.72 
 
 		 571 aa  306  8.000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  35.71 
 
 		 556 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  33.58 
 
 		 588 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  33.64 
 
 		 584 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  34.22 
 
 		 605 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  31.65 
 
 		 569 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  31.65 
 
 		 569 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  37.81 
 
 		 591 aa  289  9e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  34.61 
 
 		 588 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  34.33 
 
 		 576 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  35.22 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  36.78 
 
 		 585 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  32.73 
 
 		 563 aa  280  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.79 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  34.79 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.79 
 
 		 610 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.62 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  34.62 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.62 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.62 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  30.95 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  32.28 
 
 		 585 aa  266  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  28.24 
 
 		 571 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  29.12 
 
 		 574 aa  253  7e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  35.37 
 
 		 576 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  33.03 
 
 		 557 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  33.7 
 
 		 599 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  31.74 
 
 		 574 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  27.72 
 
 		 566 aa  247  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  32.8 
 
 		 585 aa  247  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  30.23 
 
 		 572 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  31.08 
 
 		 567 aa  242  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  35.74 
 
 		 581 aa  242  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  34.01 
 
 		 605 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  31.54 
 
 		 590 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  33.9 
 
 		 550 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  34.81 
 
 		 573 aa  237  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  29.06 
 
 		 578 aa  236  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  30.02 
 
 		 565 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  31.7 
 
 		 592 aa  236  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  29.4 
 
 		 608 aa  235  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  32.2 
 
 		 588 aa  234  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  34.7 
 
 		 558 aa  231  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  28.01 
 
 		 588 aa  229  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2980  sulphate transporter  33.02 
 
 		 558 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  31.61 
 
 		 583 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  34.98 
 
 		 570 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  31.76 
 
 		 565 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  32.96 
 
 		 551 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0095  sulphate transporter  29.6 
 
 		 550 aa  221  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>