21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1406 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1406  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  687    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4317  hypothetical protein  98.21 
 
 		 336 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00276005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4405  hypothetical protein  90.77 
 
 		 351 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1047  hypothetical protein  86.75 
 
 		 337 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1310  hypothetical protein  47.15 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0406  hypothetical protein  31.14 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.953246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1479  hypothetical protein  32.04 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.206358  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2938  hypothetical protein  30.91 
 
 		 347 aa  116  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1471  hypothetical protein  28.61 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4786  hypothetical protein  30.24 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000000305274  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2707  hypothetical protein  30.41 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000134366  hitchhiker  0.00145883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4502  hypothetical protein  28.83 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2822  hypothetical protein  29.31 
 
 		 341 aa  92.8  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154965  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3703  hypothetical protein  23.95 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0375  hypothetical protein  27.13 
 
 		 341 aa  85.9  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1116  hypothetical protein  30.6 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3551  hypothetical protein  27.35 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2837  hypothetical protein  27.38 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0779  hypothetical protein  25.18 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4098  hypothetical protein  28.92 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000500149  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1476  hypothetical protein  25.56 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00768599  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>