More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1341 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0948  cell division protein FtsA  98.57 
 
 
418 aa  829    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1341  cell division protein FtsA  100 
 
 
443 aa  897    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.722513  normal  0.0156243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4404  cell division protein FtsA  93.1 
 
 
418 aa  788    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0640092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4098  cell division protein FtsA  93.1 
 
 
418 aa  787    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14475  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4669  cell division protein FtsA  92.14 
 
 
419 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165844  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13290  cell division protein FtsA  87.86 
 
 
415 aa  748    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00675344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0852  cell division protein FtsA  78.57 
 
 
409 aa  673    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000127132  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0926  cell division protein FtsA  90.24 
 
 
415 aa  766    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.998938 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2448  cell division protein FtsA  73.81 
 
 
411 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00757496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4508  cell division protein FtsA  99.29 
 
 
420 aa  842    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00626998  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4383  cell division protein FtsA  100 
 
 
420 aa  848    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000385058  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57290  cell division protein FtsA  90 
 
 
417 aa  757    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4980  cell division protein FtsA  90 
 
 
417 aa  757    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2186  cell division protein FtsA  71.9 
 
 
423 aa  633  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0110179  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2188  cell division protein FtsA  71.43 
 
 
412 aa  617  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.083381  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0774  cell division protein FtsA  72.14 
 
 
412 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2086  cell division protein FtsA  69.29 
 
 
412 aa  609  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0360839  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2424  cell division protein FtsA  67.77 
 
 
411 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0673361  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0229  cell division protein FtsA  67.55 
 
 
410 aa  578  1e-164  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.72026e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1967  cell division protein  67.55 
 
 
413 aa  578  1e-164  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2196  cell division protein FtsA  67.86 
 
 
411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000929624  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2856  cell division protein FtsA  66.19 
 
 
411 aa  559  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000501977  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2663  ATP-binding cell division protein FtsA  63.57 
 
 
412 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2533  ATP-binding cell division protein FtsA  63.57 
 
 
412 aa  550  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0124  cell division protein FtsA  61.99 
 
 
411 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0427264  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0587  cell division protein FtsA  63.59 
 
 
417 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000283199  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2264  cell division protein FtsA  61.89 
 
 
412 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0392802  hitchhiker  0.00222131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2610  cell division protein FtsA  61.61 
 
 
424 aa  523  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  unclonable  0.00000000000528354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0201  cell division protein FtsA  61.67 
 
 
422 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0380  cell division protein FtsA  61.67 
 
 
422 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00706299  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0606  cell division protein FtsA  60.96 
 
 
411 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.943795  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04363  cell division protein FtsA  59.9 
 
 
411 aa  510  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3423  cell division protein FtsA  60.05 
 
 
409 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3494  cell division protein FtsA  57.52 
 
 
409 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0808464  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3466  cell division protein FtsA  61.17 
 
 
410 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000117297  hitchhiker  0.00107909 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2489  cell division protein FtsA  59.1 
 
 
412 aa  502  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.391008  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1965  cell division protein FtsA  59 
 
 
411 aa  504  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00000960191  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2044  cell division protein  59 
 
 
411 aa  504  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655425  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2840  cell division protein FtsA  61.17 
 
 
410 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0490  cell division protein FtsA  60.92 
 
 
410 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00369012  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2669  cell division protein FtsA  60.44 
 
 
410 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00924647  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2832  cell division protein FtsA  59.47 
 
 
410 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000848153  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3521  cell division protein FtsA  59.95 
 
 
410 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2720  cell division protein FtsA  60.44 
 
 
410 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.705635  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2547  cell division protein FtsA  59.95 
 
 
410 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0467  cell division protein FtsA  59.95 
 
 
410 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1326  cell division protein FtsA  59.95 
 
 
410 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.792019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3540  cell division protein FtsA  59.95 
 
 
410 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3649  cell division protein FtsA  59.71 
 
 
410 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00282858  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1122  cell division protein FtsA  59.95 
 
 
410 aa  498  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3546  cell division protein FtsA  59.95 
 
 
410 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3237  cell division protein FtsA  59.95 
 
 
410 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3085  cell division protein FtsA  60.44 
 
 
410 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0081  cell division protein FtsA  59.71 
 
 
410 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000240923  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0534  cell division protein FtsA  59.71 
 
 
410 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000483364  normal  0.575152 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0492  cell division protein FtsA  59.22 
 
 
410 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000474873  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0467  cell division protein FtsA  59.22 
 
 
410 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0035462  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0563  cell division protein FtsA  59.71 
 
 
410 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000205481  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2975  cell division protein FtsA  59.71 
 
 
410 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.254584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3124  cell division protein FtsA  59.95 
 
 
410 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.59264  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0171  cell division protein FtsA  60.68 
 
 
409 aa  489  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000130276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3064  cell division protein FtsA  61.83 
 
 
411 aa  488  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0416  cell division protein FtsA  60.74 
 
 
411 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.840628  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0513  cell division protein FtsA  60.75 
 
 
411 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0665  cell division protein FtsA  56.32 
 
 
411 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000156077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3969  cell division protein FtsA  56.46 
 
 
411 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000373054  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0185  cell division protein FtsA  59.71 
 
 
409 aa  477  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000415608  normal  0.589058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0496  cell division protein FtsA  60.48 
 
 
411 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00048929  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2603  cell division protein FtsA  56.13 
 
 
409 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0898076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0748  cell division protein FtsA  60.16 
 
 
412 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107961  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1117  cell division protein FtsA  56.69 
 
 
411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000192043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3284  cell division protein FtsA  55.06 
 
 
412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000382408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4461  cell division protein FtsA  54.05 
 
 
411 aa  467  9.999999999999999e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.232873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3515  cell division protein FtsA  52.86 
 
 
409 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000329989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2197  cell division protein FtsA  55.24 
 
 
409 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.0721100000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3833  cell division protein FtsA  56.54 
 
 
410 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3777  cell division protein FtsA  56.81 
 
 
410 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3917  cell division protein FtsA  56.54 
 
 
410 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0750  cell division protein FtsA  53.96 
 
 
410 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0952  cell division protein FtsA  54.79 
 
 
408 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.39676 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0745  cell division protein FtsA  55.04 
 
 
408 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0195283  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5215  cell division protein FtsA  57.07 
 
 
411 aa  455  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3808  cell division protein FtsA  53.24 
 
 
411 aa  455  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000197633  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3450  cell division protein FtsA  52.59 
 
 
411 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000166188  hitchhiker  0.000034496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0357  cell division protein FtsA  52.59 
 
 
411 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000963388  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4530  cell division protein FtsA  56.46 
 
 
411 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000264478  hitchhiker  0.000036158 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0416  cell division protein FtsA  51.19 
 
 
411 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000530477  unclonable  0.0000068927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0404  cell division protein FtsA  51.19 
 
 
411 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000380167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4216  cell division protein FtsA  51.65 
 
 
411 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0430  cell division protein FtsA  51.19 
 
 
411 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000124694  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0405  cell division protein FtsA  51.19 
 
 
411 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000457966  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4574  cell division protein FtsA  54.05 
 
 
410 aa  451  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0128686  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0490  cell division protein FtsA  51.42 
 
 
411 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000456423  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3421  cell division protein FtsA  54.85 
 
 
409 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00140443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0358  cell division protein FtsA  50.94 
 
 
411 aa  448  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107954  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0413  cell division protein FtsA  55.67 
 
 
411 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00909742  hitchhiker  0.00170264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3567  cell division protein FtsA  51.65 
 
 
411 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490068  decreased coverage  0.000000000512084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0389  cell division protein FtsA  51.65 
 
 
411 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000990996  hitchhiker  0.000418881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3740  cell division protein FtsA  51.42 
 
 
411 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000982016  hitchhiker  0.0000000353047 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1046  cell division protein FtsA  54.05 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000515882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>