More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1248 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  99.51 
 
 		 205 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  92.2 
 
 		 205 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  73.13 
 
 		 203 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  65.85 
 
 		 204 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  66 
 
 		 201 aa  265  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  65.84 
 
 		 204 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  63.86 
 
 		 204 aa  259  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  63.86 
 
 		 204 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  66.02 
 
 		 208 aa  258  9e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  62.87 
 
 		 204 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  65.37 
 
 		 204 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  63.59 
 
 		 208 aa  237  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  53.23 
 
 		 203 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.29 
 
 		 209 aa  179  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  38.03 
 
 		 221 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.3 
 
 		 212 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  34.3 
 
 		 212 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  34.3 
 
 		 212 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  33.82 
 
 		 212 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  33.82 
 
 		 212 aa  129  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  33.33 
 
 		 212 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  33.33 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  36.36 
 
 		 219 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  36.02 
 
 		 219 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  34.78 
 
 		 212 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  35.89 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  35.89 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  34.3 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  34.3 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  34.3 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  34.3 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  32.55 
 
 		 217 aa  122  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.55 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  33.49 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  33.8 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  36.41 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  35.55 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  34.27 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  36.22 
 
 		 220 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  36.22 
 
 		 220 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  36.22 
 
 		 220 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  36.22 
 
 		 220 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  36.22 
 
 		 220 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  36.22 
 
 		 220 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  36.22 
 
 		 220 aa  119  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  34.74 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  36.06 
 
 		 216 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  35.58 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  34.58 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  34.11 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  33.64 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.13 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  34.72 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  33.65 
 
 		 220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.25 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  35.71 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  27.18 
 
 		 211 aa  106  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  31.53 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  31.39 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  35.15 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  33.96 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  36.81 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  29.27 
 
 		 210 aa  99.4  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  31.53 
 
 		 225 aa  98.6  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.35 
 
 		 208 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7098  RhtB family transporter  32.82 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.84 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  35.79 
 
 		 209 aa  95.5  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  30.33 
 
 		 215 aa  95.1  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.48 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.63 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  30.85 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  26.09 
 
 		 209 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.37 
 
 		 208 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  33.96 
 
 		 213 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4188  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.63 
 
 		 216 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.0417151 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  29.47 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  29.47 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  29.47 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  29.47 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  35.98 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.82 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  36.51 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  29.47 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  36.51 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  30.32 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  29.47 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 		 214 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 203 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.98 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.88 
 
 		 208 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  29.11 
 
 		 213 aa  89.7  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.67 
 
 		 204 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 211 aa  89.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>