248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1081 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1081  glutaredoxin-related protein  100 
 
 		 111 aa  229  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.581257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1122  glutaredoxin-like protein  99.1 
 
 		 152 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1110  glutaredoxin-like protein  98.2 
 
 		 111 aa  226  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3339  glutaredoxin-like protein  91.67 
 
 		 108 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0384172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1614  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  206  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18650  hypothetical protein  89.81 
 
 		 108 aa  206  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0667348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4331  glutaredoxin-like protein  97.98 
 
 		 111 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.488621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4524  glutaredoxin-like protein  93.07 
 
 		 113 aa  201  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532221  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3898  glutaredoxin-like protein  87.5 
 
 		 108 aa  197  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.713119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14040  Glutaredoxin4 protein  84.26 
 
 		 108 aa  197  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4161  glutaredoxin-related protein  86.54 
 
 		 108 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2438  glutaredoxin-related protein  76.36 
 
 		 110 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000187955  normal  0.0679264 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002935  glutaredoxin-related protein  74.77 
 
 		 116 aa  177  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000192998  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1631  hypothetical protein  71.82 
 
 		 110 aa  177  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352705  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03013  hypothetical protein  72.48 
 
 		 116 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01624  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.521708  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1986  glutaredoxin-like protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.235572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01614  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1732  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.358242  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1544  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2366  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00389248  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1975  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1866  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000387905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1850  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3475  glutaredoxin,-like protein  76.77 
 
 		 116 aa  170  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1529  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1741  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000591153  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1603  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1910  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1543  hypothetical protein  72.9 
 
 		 115 aa  170  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.416029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2670  hypothetical protein  72.22 
 
 		 116 aa  169  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0262215  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1793  hypothetical protein  71.03 
 
 		 115 aa  169  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.169606  normal  0.0260358 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2129  glutaredoxin-like protein  72.38 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.883675  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1758  hypothetical protein  68.18 
 
 		 116 aa  168  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1866  hypothetical protein  68.18 
 
 		 116 aa  168  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2569  hypothetical protein  68.18 
 
 		 116 aa  168  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0109727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2386  hypothetical protein  70.37 
 
 		 116 aa  167  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0290699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3388  glutaredoxin-like protein  70.75 
 
 		 109 aa  167  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.459255  normal  0.239887 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1686  glutaredoxin-like protein  69.16 
 
 		 114 aa  167  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1396  glutaredoxin-like protein  67.62 
 
 		 109 aa  166  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.420177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02749  putative glutaredoxin like protein  71.03 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1718  hypothetical protein  69.16 
 
 		 116 aa  166  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000856261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2198  hypothetical protein  70.09 
 
 		 115 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390421  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1919  glutaredoxin-related protein  67.27 
 
 		 110 aa  165  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00265167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1859  putative glutaredoxin  70.48 
 
 		 111 aa  164  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2449  glutaredoxin-like protein  63.96 
 
 		 112 aa  163  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182264  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1820  glutaredoxin-like protein  64.55 
 
 		 110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000369012  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1776  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 		 110 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000936402  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1783  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 		 110 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000151147  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2502  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 		 110 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000230073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1688  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 		 110 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1835  glutaredoxin-like protein  64.55 
 
 		 116 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  0.937939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1964  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 		 113 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0459539  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1573  glutaredoxin-like protein  62.73 
 
 		 110 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000259728  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1648  glutaredoxin-like protein  62.73 
 
 		 110 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000432966  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1640  glutaredoxin-like protein  62.73 
 
 		 110 aa  160  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000581694  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2880  glutaredoxin domain-containing protein  61.82 
 
 		 110 aa  158  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1748  glutaredoxin-like protein  61.26 
 
 		 113 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425193  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2160  glutaredoxin-like protein  61.47 
 
 		 116 aa  157  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.277546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1640  glutaredoxin-like protein  61.11 
 
 		 111 aa  156  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000518322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2444  glutaredoxin-like protein  61.47 
 
 		 115 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72039  normal  0.0565869 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1034  glutaredoxin-like protein  63.81 
 
 		 108 aa  154  5.0000000000000005e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000907202  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3038  glutaredoxin-like protein  62.5 
 
 		 115 aa  150  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2896  glutaredoxin-like protein  62.5 
 
 		 115 aa  150  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2316  glutaredoxin-like protein  62.04 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.102324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2427  glutaredoxin-like protein  61.17 
 
 		 110 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.17903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  57.27 
 
 		 110 aa  139  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0963  glutaredoxin-like protein  59.8 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0729  glutaredoxin-like protein  56.6 
 
 		 111 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  57.69 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1242  glutaredoxin-related protein  59.6 
 
 		 116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.828915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1150  glutaredoxin-like protein  59.6 
 
 		 116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2499  glutaredoxin-like protein  59.22 
 
 		 106 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  50.46 
 
 		 109 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0349  glutaredoxin-like protein  49.54 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.508433 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0086  glutaredoxin-related protein  54.29 
 
 		 119 aa  132  9.999999999999999e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0938468  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1149  glutaredoxin-like protein  52.34 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  53.85 
 
 		 109 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0596  glutaredoxin-like protein  51.82 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.097988  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2647  glutaredoxin-like protein  54.37 
 
 		 110 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3038  glutaredoxin-related protein  54.37 
 
 		 110 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2639  glutaredoxin-like protein  52.83 
 
 		 106 aa  123  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.49425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  56.44 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01315  putative glutaredoxin-like protein  48.54 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.359363  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  51.43 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51060  glutaredoxin-related protein  53.33 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0783867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  50.98 
 
 		 109 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1374  glutaredoxin-like protein  47.12 
 
 		 106 aa  117  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.431306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2225  monothiol glutaredoxin  45.63 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  49 
 
 		 103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  49 
 
 		 103 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  49 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  49 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  49 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  49 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  49 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  49 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0354  glutaredoxin-like protein  44.86 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0757306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  49 
 
 		 102 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  47.57 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.441106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>