More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1000 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1000  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 336 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5912  ornithine carbamoyltransferase  91.07 
 
 		 336 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4387  ornithine carbamoyltransferase  95.24 
 
 		 336 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1107  ornithine carbamoyltransferase  90.18 
 
 		 336 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7762  normal  0.256568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4224  ornithine carbamoyltransferase  99.11 
 
 		 336 aa  702    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0999  ornithine carbamoyltransferase  99.7 
 
 		 336 aa  705    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68340  ornithine carbamoyltransferase  91.67 
 
 		 336 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.170592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1037  ornithine carbamoyltransferase  99.7 
 
 		 336 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2685  ornithine carbamoyltransferase  83.93 
 
 		 336 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.841413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2385  ornithine carbamoyltransferase  83.04 
 
 		 336 aa  597  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0499309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1146  ornithine carbamoyltransferase  82.74 
 
 		 336 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2127  ornithine carbamoyltransferase  82.74 
 
 		 336 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0914  ornithine carbamoyltransferase  82.74 
 
 		 336 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12594  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6442  ornithine carbamoyltransferase  82.74 
 
 		 336 aa  595  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.316397  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1986  ornithine carbamoyltransferase  82.74 
 
 		 336 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.370878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1586  ornithine carbamoyltransferase  82.74 
 
 		 336 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0245  ornithine carbamoyltransferase  82.74 
 
 		 336 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380448  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1967  ornithine carbamoyltransferase  82.44 
 
 		 336 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604049  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4538  ornithine carbamoyltransferase  81.55 
 
 		 336 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0837196  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0747  ornithine carbamoyltransferase  75.53 
 
 		 333 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0828856 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2425  ornithine carbamoyltransferase  73.05 
 
 		 334 aa  541  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1390  ornithine carbamoyltransferase  75.15 
 
 		 334 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00030197  normal  0.635885 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5203  ornithine carbamoyltransferase  70.75 
 
 		 334 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002420  ornithine carbamoyltransferase  65.67 
 
 		 334 aa  485  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03645  ornithine carbamoyltransferase  65.07 
 
 		 334 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5576  ornithine carbamoyltransferase  65.57 
 
 		 332 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1876  ornithine carbamoyltransferase  65.57 
 
 		 332 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2091  ornithine carbamoyltransferase  65.37 
 
 		 334 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.63428  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0520  ornithine carbamoyltransferase  65.67 
 
 		 334 aa  475  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1976  ornithine carbamoyltransferase  65.96 
 
 		 332 aa  473  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2799  ornithine carbamoyltransferase  66.07 
 
 		 334 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0450  ornithine carbamoyltransferase  63.99 
 
 		 334 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.601732  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0433  ornithine carbamoyltransferase  64.07 
 
 		 333 aa  461  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.776106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4748  ornithine carbamoyltransferase  63.39 
 
 		 334 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1992  ornithine carbamoyltransferase  63.88 
 
 		 334 aa  454  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4867  ornithine carbamoyltransferase  63.39 
 
 		 334 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4811  ornithine carbamoyltransferase  63.39 
 
 		 334 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.278589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4847  ornithine carbamoyltransferase  63.39 
 
 		 334 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4647  ornithine carbamoyltransferase  64.37 
 
 		 333 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2240  ornithine carbamoyltransferase  62.57 
 
 		 333 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385823  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4042  ornithine carbamoyltransferase subunit I  61.98 
 
 		 335 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3684  ornithine carbamoyltransferase subunit I  61.68 
 
 		 335 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3549  ornithine carbamoyltransferase subunit I  61.68 
 
 		 335 aa  440  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3732  ornithine carbamoyltransferase subunit I  62.54 
 
 		 338 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0374  ornithine carbamoyltransferase subunit I  62.24 
 
 		 335 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2176  ornithine carbamoyltransferase  60.78 
 
 		 332 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3566  ornithine carbamoyltransferase subunit I  61.93 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0554  ornithine carbamoyltransferase  62.05 
 
 		 339 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0425  ornithine carbamoyltransferase subunit I  61.93 
 
 		 335 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4872  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60.54 
 
 		 334 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4754  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60.54 
 
 		 334 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4724  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60.54 
 
 		 334 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0459  ornithine carbamoyltransferase subunit F  60.42 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0130179 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4853  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60.54 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5775  ornithine carbamoyltransferase subunit I  59.64 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4817  ornithine carbamoyltransferase subunit I  60.24 
 
 		 334 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4825  ornithine carbamoyltransferase subunit I  59.58 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04120  ornithine carbamoyltransferase 1  59.34 
 
 		 334 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3332  ornithine carbamoyltransferase  59.16 
 
 		 334 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3743  ornithine carbamoyltransferase  59.04 
 
 		 334 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04084  hypothetical protein  59.34 
 
 		 334 aa  421  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4510  ornithine carbamoyltransferase subunit I  59.34 
 
 		 334 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0746684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4734  ornithine carbamoyltransferase subunit I  59.34 
 
 		 334 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.488433  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3758  ornithine carbamoyltransferase subunit I  59.34 
 
 		 334 aa  421  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4829  ornithine carbamoyltransferase subunit I  58.73 
 
 		 334 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1227  ornithine carbamoyltransferase  58.26 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.149639  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1252  ornithine carbamoyltransferase  58.26 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2351  ornithine carbamoyltransferase  57.66 
 
 		 333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0425  ornithine carbamoyltransferase  55.52 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2126  ornithine carbamoyltransferase  56.02 
 
 		 332 aa  391  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0090  ornithine carbamoyltransferase, catabolic  54.76 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1908  ornithine carbamoyltransferase  58.44 
 
 		 331 aa  391  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000351047  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1676  ornithine carbamoyltransferase  56.19 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0031  ornithine carbamoyltransferase  53.73 
 
 		 334 aa  378  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0068  ornithine carbamoyltransferase  54.79 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06660  ornithine carbamoyltransferase  53.73 
 
 		 331 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000120015  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0929  ornithine carbamoyltransferase  53.13 
 
 		 338 aa  371  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.142101  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0930  ornithine carbamoyltransferase  55.62 
 
 		 317 aa  369  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000010052  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0872  ornithine carbamoyltransferase  54.82 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00322562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00840  ornithine carbamoyltransferase  51.95 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.96498 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02370  ornithine carbamoyltransferase  51.95 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0182  ornithine carbamoyltransferase  52.24 
 
 		 330 aa  362  6e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1948  ornithine carbamoyltransferase  52.69 
 
 		 331 aa  359  3e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0387191  normal  0.307808 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0158  ornithine carbamoyltransferase  52.25 
 
 		 331 aa  355  5.999999999999999e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0162  ornithine carbamoyltransferase  52.25 
 
 		 331 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06550  ornithine carbamoyltransferase  50.3 
 
 		 331 aa  353  2e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  0.675152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0473  ornithine carbamoyltransferase  51.35 
 
 		 332 aa  351  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0408  ornithine carbamoyltransferase  51.05 
 
 		 332 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.297743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0421  ornithine carbamoyltransferase  51.05 
 
 		 332 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0349  ornithine carbamoyltransferase  51.35 
 
 		 332 aa  349  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0342  ornithine carbamoyltransferase  51.05 
 
 		 332 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2165  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 		 337 aa  347  2e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  51.51 
 
 		 312 aa  346  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4897  ornithine carbamoyltransferase  50.15 
 
 		 332 aa  343  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2708  ornithine carbamoyltransferase  50.9 
 
 		 338 aa  329  4e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2321  ornithine carbamoyltransferase  49.25 
 
 		 354 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0649  ornithine carbamoyltransferase  52.19 
 
 		 326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0046026  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  49.25 
 
 		 332 aa  323  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2658  ornithine carbamoyltransferase  49.1 
 
 		 336 aa  322  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2714  ornithine carbamoyltransferase  49.1 
 
 		 336 aa  322  4e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>