More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0980 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  92.56 
 
 		 497 aa  942    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  100 
 
 		 497 aa  1005    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  78.43 
 
 		 496 aa  797    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  76.77 
 
 		 496 aa  776    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  78.02 
 
 		 496 aa  797    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  80.68 
 
 		 496 aa  820    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  79.39 
 
 		 495 aa  771    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  98.39 
 
 		 497 aa  989    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  97.99 
 
 		 497 aa  986    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  79.6 
 
 		 495 aa  749    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  78.99 
 
 		 512 aa  783    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  56.02 
 
 		 496 aa  558  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  57.55 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  56.6 
 
 		 518 aa  551  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  57.72 
 
 		 497 aa  554  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03635  leucyl aminopeptidase  53.51 
 
 		 502 aa  546  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  53.91 
 
 		 502 aa  547  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002428  cytosol aminopeptidase PepA  53.51 
 
 		 502 aa  545  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00175472  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0740  leucyl aminopeptidase  54.02 
 
 		 501 aa  544  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  58.32 
 
 		 499 aa  544  1e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 		 502 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 		 502 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  54.42 
 
 		 498 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  53.11 
 
 		 502 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2083  leucyl aminopeptidase  53.11 
 
 		 503 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000600102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3679  leucyl aminopeptidase  54.6 
 
 		 503 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0257256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1014  leucyl aminopeptidase  52.91 
 
 		 502 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0465604  normal  0.808003 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4047  leucyl aminopeptidase  54.6 
 
 		 503 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00149505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  52.51 
 
 		 502 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 		 502 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3543  leucyl aminopeptidase  54.6 
 
 		 503 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00770626  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  52.51 
 
 		 502 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 		 502 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 		 502 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 		 502 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0939  leucyl aminopeptidase  52.71 
 
 		 502 aa  537  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.245826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  51.5 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0526  leucyl aminopeptidase  52.51 
 
 		 502 aa  538  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0735759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1076  leucyl aminopeptidase  52.3 
 
 		 502 aa  535  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0190451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  51.9 
 
 		 502 aa  535  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01576  leucyl aminopeptidase  52.72 
 
 		 513 aa  534  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.327034  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04126  leucyl aminopeptidase  53.4 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3737  Leucyl aminopeptidase  53.4 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662158  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4733  leucyl aminopeptidase  53.2 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138793  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4516  leucyl aminopeptidase  53.4 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000167051  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3752  leucyl aminopeptidase  53.4 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5781  leucyl aminopeptidase  53.4 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0325394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3648  leucyl aminopeptidase  53.2 
 
 		 503 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.433879  normal  0.196646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4763  leucyl aminopeptidase  53.2 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000189037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4821  leucyl aminopeptidase  53.2 
 
 		 503 aa  529  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4832  leucyl aminopeptidase  53.4 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000259407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04090  hypothetical protein  53.4 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0200795  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4882  leucyl aminopeptidase  53.2 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4863  leucyl aminopeptidase  53.2 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0321011  normal  0.585074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4740  leucyl aminopeptidase  53.4 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000218455  normal  0.712457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4826  leucyl aminopeptidase  53.2 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.956713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  54.91 
 
 		 500 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3557  leucyl aminopeptidase  52.51 
 
 		 502 aa  527  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0562  leucyl aminopeptidase  52.6 
 
 		 503 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00163208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  54.62 
 
 		 497 aa  524  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  51.7 
 
 		 501 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3562  leucyl aminopeptidase  51.2 
 
 		 501 aa  524  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3720  leucyl aminopeptidase  52.51 
 
 		 502 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0395  leucyl aminopeptidase  51.11 
 
 		 504 aa  521  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0444  leucyl aminopeptidase  51.4 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0984  leucyl aminopeptidase  54.66 
 
 		 508 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2471  leucyl aminopeptidase  54.43 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5797  leucyl aminopeptidase  54.43 
 
 		 503 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0828  leucyl aminopeptidase  54.85 
 
 		 503 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2383  leucyl aminopeptidase  54.43 
 
 		 503 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1855  leucyl aminopeptidase  54.43 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0388  leucyl aminopeptidase  51.4 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  54.87 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2466  leucyl aminopeptidase  54.43 
 
 		 503 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  55.58 
 
 		 492 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2683  leucyl aminopeptidase  53.25 
 
 		 510 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417849  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3638  leucyl aminopeptidase  54.04 
 
 		 508 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2807  leucyl aminopeptidase  53.25 
 
 		 510 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.494526  normal  0.367433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  56.4 
 
 		 486 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2515  leucyl aminopeptidase  54.23 
 
 		 503 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.880203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  50.5 
 
 		 503 aa  495  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  54.64 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  54.43 
 
 		 503 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  54.23 
 
 		 503 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  54.23 
 
 		 503 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  54.23 
 
 		 503 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  54.23 
 
 		 503 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  50.4 
 
 		 506 aa  490  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  54.23 
 
 		 503 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  54.23 
 
 		 503 aa  490  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2679  leucyl aminopeptidase  53.36 
 
 		 502 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0681  leucyl aminopeptidase  51.2 
 
 		 499 aa  487  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2219  leucyl aminopeptidase  52.67 
 
 		 502 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2415  leucyl aminopeptidase  53.55 
 
 		 506 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0516  leucyl aminopeptidase  47.48 
 
 		 495 aa  479  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.204663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2918  leucyl aminopeptidase  54.51 
 
 		 507 aa  476  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1372  PepA aminopeptidase  49 
 
 		 500 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00219967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0287  leucyl aminopeptidase  46.68 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1857  Leucyl aminopeptidase  49.7 
 
 		 500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>