More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0929 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  100 
 
 		 124 aa  253  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  99.19 
 
 		 124 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  98.39 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  92.74 
 
 		 155 aa  236  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  79.03 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  75.21 
 
 		 145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  78.5 
 
 		 122 aa  182  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  67.89 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  72.04 
 
 		 125 aa  137  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  70.79 
 
 		 140 aa  133  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  63 
 
 		 211 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  67.02 
 
 		 199 aa  130  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  62.73 
 
 		 114 aa  130  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  64.95 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 230 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 211 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 211 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  49.59 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 242 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 242 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 211 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  61 
 
 		 230 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12600  Rare lipoprotein A, RplA  57.41 
 
 		 123 aa  127  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817198  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  62.92 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  63.54 
 
 		 200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 358 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 137 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  49.58 
 
 		 137 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  63.54 
 
 		 200 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 170 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  55 
 
 		 121 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  60.44 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  58.43 
 
 		 163 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 171 aa  123  9e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  59.78 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  54.4 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  59.38 
 
 		 285 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  57.26 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  56.25 
 
 		 144 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  56 
 
 		 203 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  56 
 
 		 203 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  62.92 
 
 		 171 aa  120  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  53.77 
 
 		 339 aa  120  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  55 
 
 		 202 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 324 aa  120  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  55 
 
 		 214 aa  120  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1713  putative rare lipoprotein A  49.49 
 
 		 293 aa  120  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  57.29 
 
 		 238 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  60.42 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  67.78 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 186 aa  119  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  57.73 
 
 		 286 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  59.38 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  54.55 
 
 		 342 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  60.19 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  57.14 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  61.46 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  63.74 
 
 		 168 aa  117  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  56.12 
 
 		 282 aa  117  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  52.58 
 
 		 163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  59.38 
 
 		 322 aa  117  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  53.54 
 
 		 341 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 332 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  47.66 
 
 		 131 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 371 aa  116  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 342 aa  116  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  53 
 
 		 203 aa  116  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  52.04 
 
 		 243 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  54.64 
 
 		 257 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  64.84 
 
 		 335 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  53 
 
 		 213 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  51.52 
 
 		 342 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  55.96 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  65.91 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  64.04 
 
 		 324 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  53.54 
 
 		 325 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  53 
 
 		 213 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 262 aa  115  3e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  53.54 
 
 		 333 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 142 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  50.53 
 
 		 265 aa  114  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  50.51 
 
 		 342 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 128 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  56.84 
 
 		 381 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  57.69 
 
 		 255 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  53.54 
 
 		 333 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  47.62 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  52.53 
 
 		 333 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  55.43 
 
 		 239 aa  114  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  48.7 
 
 		 297 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  54.64 
 
 		 259 aa  114  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  46.15 
 
 		 129 aa  114  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3711  rare lipoprotein A  49.47 
 
 		 264 aa  114  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000309694  hitchhiker  0.000358046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>