93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0837 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0837  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  354  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0867  hypothetical protein  99.43 
 
 		 176 aa  343  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.430194  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0880  hypothetical protein  98.3 
 
 		 176 aa  341  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4341  hypothetical protein  97.16 
 
 		 177 aa  313  8e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.4665  hitchhiker  0.0000000405508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4617  hypothetical protein  85.88 
 
 		 182 aa  279  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00650185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1232  hypothetical protein  79.21 
 
 		 179 aa  266  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.4462  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1294  hypothetical protein  77.97 
 
 		 182 aa  262  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14660  hypothetical protein  77.97 
 
 		 182 aa  260  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3516  hypothetical protein  75.56 
 
 		 180 aa  260  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.672109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1417  hypothetical protein  78.09 
 
 		 179 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1490  hypothetical protein  58.52 
 
 		 179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309897 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1288  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1326  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000689224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  57.95 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01114  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  57.39 
 
 		 179 aa  207  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  207  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  54.49 
 
 		 178 aa  197  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1625  hypothetical protein  58.82 
 
 		 175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.813311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2791  hypothetical protein  58.19 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1609  hypothetical protein  54.19 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2485  hypothetical protein  59.32 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1705  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1597  hypothetical protein  57.95 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0188562  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2866  hypothetical protein  57.39 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1640  hypothetical protein  55.62 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0746149  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0102  hypothetical protein  55.62 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0764912 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1533  hypothetical protein  51.69 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  39.86 
 
 		 257 aa  94  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  38.1 
 
 		 257 aa  93.6  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04806  outer membrane protein  43.36 
 
 		 263 aa  91.3  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06571  hypothetical protein  44.9 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000695  hypothetical protein  45.95 
 
 		 172 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.86494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0164  17 kDa surface antigen  37.14 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3687  17 kDa surface antigen  34.75 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1954  17 kDa surface antigen  35.09 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000188726  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1170  17 kDa surface antigen  51.22 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1384  17 kDa surface antigen  35 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0378  17 kDa surface antigen  35.71 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  60.87 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  63.04 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  63.04 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  63.04 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  63.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  63.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  63.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  63.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  63.04 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  60.87 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  63.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  63.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  63.04 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  66.67 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  60.87 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2356  putative outer membrane lipoprotein  29.63 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.662558  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2643  17 kDa surface antigen  36.42 
 
 		 280 aa  51.6  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.796605  normal  0.311018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  38.16 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2622  hypothetical protein  38.46 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1727  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000263697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2052  hypothetical protein  45 
 
 		 155 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000276746  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1652  17 kDa surface antigen  38.46 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000172178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1757  17 kDa surface antigen  37.38 
 
 		 147 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000073012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  57.14 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  57.14 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3376  17 kDa surface antigen  34.52 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04299  17 kDa surface antigen family protein  32.29 
 
 		 126 aa  47.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  48 
 
 		 225 aa  47.8  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02005  17 kDa surface antigen family protein  32.98 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  46.3 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2695  17 kDa surface antigen  44.44 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000023242  normal  0.114925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  52.38 
 
 		 217 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1377  surface antigen protein  35.82 
 
 		 146 aa  44.7  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.113314  normal  0.0505694 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  57.14 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  44.23 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  41.51 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1858  17 kDa surface antigen  36.03 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.699281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3476  17 kDa surface antigen  70.37 
 
 		 84 aa  42  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  37.31 
 
 		 259 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  55.81 
 
 		 294 aa  41.6  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  55.81 
 
 		 280 aa  41.2  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4774  17 kDa surface antigen  34.45 
 
 		 213 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0665442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2231  17 kDa surface antigen  36.3 
 
 		 226 aa  41.2  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.302899  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2741  17 kDa surface antigen  36.3 
 
 		 226 aa  41.2  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.29195  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  55.26 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  52.83 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  48.65 
 
 		 155 aa  40.8  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>