89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0830 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0830  acetyltransferase  100 
 
 
159 aa  332  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00814406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  96.23 
 
 
159 aa  321  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0870  GCN5-related N-acetyltransferase  86.79 
 
 
159 aa  301  3e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2758  GCN5-related N-acetyltransferase  58.71 
 
 
161 aa  202  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.816345  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3162  acetyltransferase, GNAT family  58.71 
 
 
161 aa  202  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  52.29 
 
 
165 aa  187  6e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63350  GNAT family acetyltransferase  56.33 
 
 
160 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0386363  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2351  GCN5-related N-acetyltransferase  55.13 
 
 
158 aa  185  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.470821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3570  acetyltransferase, GNAT family  51.66 
 
 
197 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5516  hypothetical protein  55.06 
 
 
160 aa  182  1e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  52.23 
 
 
161 aa  164  3e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.688854  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
173 aa  81.3  5e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3935  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
158 aa  57.8  6e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
168 aa  54.7  5e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  25.47 
 
 
175 aa  52.8  2e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.360352  normal  0.789976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0653  acetyltransferase  33.67 
 
 
168 aa  51.6  4e-06  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0643  acetyltransferase, GNAT family  33.67 
 
 
168 aa  51.6  4e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0714  acetyltransferase, GNAT family  33.67 
 
 
168 aa  51.6  4e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0501  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
170 aa  52  4e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0587  acetyltransferase  33.67 
 
 
168 aa  51.6  4e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0555  acetyltransferase  33.67 
 
 
168 aa  51.6  4e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0497  acetyltransferase, GNAT  33.67 
 
 
168 aa  51.6  4e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0655  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
180 aa  51.2  6e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0499  acetyltransferase  32.65 
 
 
168 aa  50.4  1e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0625  acetyltransferase, GNAT family  32.65 
 
 
168 aa  50.1  1e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4712  acetyltransferase, GNAT family  32.65 
 
 
168 aa  50.1  1e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0583  acetyltransferase  33.75 
 
 
170 aa  49.7  2e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0621  acetyltransferase, GNAT family  33.75 
 
 
170 aa  49.7  2e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0494  acetyltransferase  33.75 
 
 
170 aa  49.7  2e-05  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.226849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0552  acetyltransferase  33.75 
 
 
170 aa  49.7  2e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0497  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
170 aa  49.7  2e-05  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3736  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
252 aa  49.7  2e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.944087  normal  0.406505 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4718  acetyltransferase, GNAT family  33.75 
 
 
170 aa  49.7  2e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0709  acetyltransferase, GNAT family  33.75 
 
 
170 aa  49.7  2e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0639  acetyltransferase, GNAT family  33.75 
 
 
170 aa  49.7  2e-05  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0647  acetyltransferase  33.75 
 
 
170 aa  49.7  2e-05  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0496  acetyltransferase  33.75 
 
 
170 aa  49.7  2e-05  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0826  putative acetyltransferase  27.27 
 
 
158 aa  47.8  6e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.450111  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2638  putative acetyltransferase  22.84 
 
 
186 aa  47.8  7e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1730  GCN5-related N-acetyltransferase  23.13 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.421002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0310  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.132707  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1811  acetyltransferase  29.01 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0798  putative acetyltransferase  27.35 
 
 
230 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  31.76 
 
 
365 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1088  acetyltransferase  29.77 
 
 
187 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  31.76 
 
 
365 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
162 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570513  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.46 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2331  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
166 aa  44.3  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0194568  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0940  acetyltransferase  28.24 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1897  putative acetyltransferase protein  36.62 
 
 
187 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.385143  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0205  acetyltransferase  28.24 
 
 
187 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1401  acetyltransferase  28.24 
 
 
187 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0356  acetyltransferase  36.62 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.25 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0319315 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0442  acetyltransferase  29.01 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0137  GCN5-related N-acetyltransferase  26.81 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2170  acetyltransferase  42.59 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08700  acetyltransferase  26.81 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2277  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.03 
 
 
167 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.91 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  29.5 
 
 
161 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.81009e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  40.28 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0552  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 
209 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2598  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  24.83 
 
 
154 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4431  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110748  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5129  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601206  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.701884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0549  GCN5-related N-acetyltransferase  26.87 
 
 
146 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2640  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
184 aa  41.6  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221093  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30760  putative acetyltransferase  20.99 
 
 
186 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  7.31371e-08 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2557  acetyltransferase  23.02 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238208  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.83 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1715  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.92 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0413  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.81 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.32 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.64567e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  30.19 
 
 
162 aa  40.8  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.36 
 
 
314 aa  40.8  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0561  putative acetyltransferase  26.57 
 
 
161 aa  40.8  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2497  GCN5-related N-acetyltransferase  36.76 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12144  normal  0.087022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
381 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4699  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
189 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.56 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
169 aa  40.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>