More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0794 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 315 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  98.41 
 
 		 315 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  90.79 
 
 		 315 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  82.86 
 
 		 315 aa  497  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  68.05 
 
 		 313 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  67.21 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  63.58 
 
 		 313 aa  359  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  63.26 
 
 		 313 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  60.33 
 
 		 315 aa  338  7e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  60 
 
 		 314 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  59.62 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  45.6 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  46.13 
 
 		 323 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  46.77 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  45.1 
 
 		 317 aa  249  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  43.18 
 
 		 313 aa  248  8e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  46.08 
 
 		 322 aa  232  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  46.28 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 312 aa  225  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  44.59 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  44.92 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  44.59 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  44.59 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  44.59 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  44.59 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  44.59 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  44.59 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  44.59 
 
 		 312 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  42.38 
 
 		 322 aa  202  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  39.72 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  42.54 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  47.78 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  38.93 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  41.14 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  46.49 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  40.07 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  35.19 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  43.12 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  36.48 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  38.6 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  38.06 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  36.07 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  36.07 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  37.94 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  39.04 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  35.4 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  33.97 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  37.42 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  42.91 
 
 		 328 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  42.32 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  38.64 
 
 		 315 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  36.05 
 
 		 303 aa  169  8e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  37.74 
 
 		 312 aa  168  9e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  43.6 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  38.41 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  36.68 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  36.43 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  35.82 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  34.29 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  33.59 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  36.05 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  36.05 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  30.32 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  38.02 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  31.17 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  40.6 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  33.72 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.82 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  39.55 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  31.42 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  34.5 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  31.15 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  34.11 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  30.43 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  30.29 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  40.67 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  33.21 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  33.95 
 
 		 303 aa  152  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  38.87 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  35.27 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>