80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0771 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  100 
 
 
115 aa  230  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  87.83 
 
 
115 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  76.52 
 
 
115 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  66.09 
 
 
116 aa  155  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  66.09 
 
 
116 aa  153  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  52.17 
 
 
116 aa  120  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  52.17 
 
 
116 aa  120  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  52.17 
 
 
116 aa  120  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  50.88 
 
 
121 aa  120  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  52.17 
 
 
116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  52.29 
 
 
108 aa  110  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.067207 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3768  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.96 
 
 
104 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.38 
 
 
108 aa  105  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3503  plasmid stable inheritance protein K  50.49 
 
 
103 aa  103  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2866  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.22 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134272  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.37 
 
 
112 aa  89  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.37 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.37 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.19 
 
 
115 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9913  plasmid stable inheritance protein K  34.58 
 
 
120 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.703725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.37 
 
 
115 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.32 
 
 
109 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.96 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.12 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  37.38 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.7 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.04 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.78 
 
 
116 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0785  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.39 
 
 
123 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4869  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.36 
 
 
148 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536474  unclonable  0.0000000999645 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  42.17 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.19 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.34 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.53 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  34.69 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  34.69 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.69 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  34.69 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  34.69 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  34.69 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  34.69 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  34.69 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.9 
 
 
124 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  34.69 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.41 
 
 
118 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.11 
 
 
119 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.79 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.84 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  36.47 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.55 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0352  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.35 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.71 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.19 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  31.58 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2716  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.71 
 
 
111 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  30.59 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.84 
 
 
107 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.14 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.46 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.25 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.03 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  28.71 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1071  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.3 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.69 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0962  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.5 
 
 
170 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.07 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.17 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.98 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.85 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3307  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50 
 
 
48 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2049  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
108 aa  42  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.97 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.71 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0256  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.38 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117261  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  34.31 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2583  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.03 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4535  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.11 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0469599  normal  0.805558 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.52 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>