More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0727 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0727  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29431  hypothetical protein  38.54 
 
 		 207 aa  131  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7109  hypothetical protein  39.9 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5513  glutamine amidotransferase class-I  38.58 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1405  peptidase C26  39.32 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0772  peptidase C26  37.93 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3393  peptidase C26  36.04 
 
 		 213 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0661  peptidase C26  30.21 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.576889 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0015  peptidase C26  37.04 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0315  conserved hypothetical protein, putative glutamine amidotransferase  30.46 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1416  class I glutamine amidotransferase, putative  25.13 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0610081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  31.03 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  27.98 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1631  glutamine amidotransferase class-I  28.09 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12660  predicted glutamine amidotransferase  31.35 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1750  hypothetical protein  27.78 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  29.36 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  31.37 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  26.67 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  32.47 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  28.43 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  26.15 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  31.92 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0498  peptidase C26  32 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  29.7 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0509  peptidase C26  32 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  29.77 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0520  peptidase C26  32 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4678  hypothetical protein  30.07 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  27.39 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  25 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  29.03 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  34.85 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  27.92 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  27.31 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  30.93 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  30.32 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  27.31 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  30.93 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  28.44 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  28.1 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  27.75 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  21.96 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  28.43 
 
 		 273 aa  61.2  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  26.96 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  29.86 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  30.73 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  27.03 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  29.58 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  28.02 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  30.81 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  28.02 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  30.19 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  32.14 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  32.42 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  27.4 
 
 		 513 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1684  anthranilate synthase component II  29.05 
 
 		 535 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  27.82 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  27.4 
 
 		 513 aa  58.9  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  27.78 
 
 		 575 aa  58.5  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3159  peptidase C26  35.34 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  28.03 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  27.4 
 
 		 513 aa  58.2  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 		 313 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0460  GMP synthase, large subunit  29.05 
 
 		 517 aa  57.4  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.797387  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  26.01 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  24.65 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  24.31 
 
 		 528 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  28.95 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  28.97 
 
 		 542 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  28.57 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  31.12 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  29.44 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  24.77 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  24.83 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  27.88 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  27.54 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  27.32 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  28.29 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  32.97 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  34.18 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  32.97 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0550  GMP synthase  26.99 
 
 		 540 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  25.41 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  30.46 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  28.06 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  30.57 
 
 		 533 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  24.66 
 
 		 507 aa  55.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  27.14 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  26.9 
 
 		 511 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  29.83 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  30.26 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2121  peptidase C26  30.92 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0384981  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  31.69 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  33.88 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  32.42 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  27.43 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  29.8 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  28.17 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  29.8 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>