More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0604 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 171 aa  343  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  99.42 
 
 		 171 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  95.32 
 
 		 171 aa  285  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  85.96 
 
 		 168 aa  275  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  79.04 
 
 		 169 aa  274  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  79.04 
 
 		 169 aa  274  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  85.38 
 
 		 170 aa  270  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  79.55 
 
 		 173 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  73.78 
 
 		 167 aa  253  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  74.07 
 
 		 169 aa  231  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  56.13 
 
 		 154 aa  164  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  57.24 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  51.63 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  49.37 
 
 		 163 aa  148  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  50.63 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  51.01 
 
 		 202 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  48.72 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  47.83 
 
 		 164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  55 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  48.72 
 
 		 171 aa  140  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  50.33 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  42.77 
 
 		 180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  46.01 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  46.01 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  46.01 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  52 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  52 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  45.4 
 
 		 171 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  42.44 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  43.43 
 
 		 178 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  43.45 
 
 		 171 aa  137  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  45.12 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  44.51 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  44.51 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  44.51 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  43.29 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  44.94 
 
 		 171 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  43.86 
 
 		 170 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  51.97 
 
 		 150 aa  134  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 		 168 aa  134  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  44.12 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  46.36 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  44.38 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  44.19 
 
 		 174 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  47.13 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  45.22 
 
 		 172 aa  131  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  40.94 
 
 		 176 aa  131  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  43.87 
 
 		 162 aa  131  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  45.52 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  43.75 
 
 		 169 aa  130  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  45.51 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  48.7 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  47.74 
 
 		 169 aa  130  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  43.12 
 
 		 173 aa  130  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  41.94 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  47.47 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  39.29 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  45.28 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  43.71 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 163 aa  128  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  47.77 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  45.96 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  44.03 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  41.92 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  43.37 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  43.37 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  41.32 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  43.37 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  46.5 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  48.12 
 
 		 216 aa  125  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  43.4 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  42.17 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  41.32 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  50 
 
 		 155 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  43.79 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  42.59 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  47.31 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  42.57 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  46.05 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  42.07 
 
 		 163 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  44.83 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  44.83 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  41.57 
 
 		 166 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  47.02 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  44.08 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>