81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0576 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0576  putative lipoprotein  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0615  hypothetical protein  98.94 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0621  lipoprotein  97.35 
 
 		 189 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4588  lipoprotein  89.95 
 
 		 189 aa  291  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0554174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0639  putative lipoprotein  65.61 
 
 		 188 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0346116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0738  lipoprotein, putative  67.02 
 
 		 187 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5515  putative lipoprotein  70.97 
 
 		 187 aa  234  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63340  putative lipoprotein  70.97 
 
 		 187 aa  233  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0331775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0635  putative lipoprotein  74.05 
 
 		 185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07240  hypothetical protein  60.82 
 
 		 181 aa  222  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0738  hypothetical protein  66.86 
 
 		 184 aa  198  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2845  hypothetical protein  33.51 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0259997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1340  hypothetical protein  32.97 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00506631  hitchhiker  0.000123504 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1843  conserved hypothetical protein, secreted  32.79 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.547906  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1240  hypothetical protein  30.65 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2469  hypothetical protein  33.86 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.456513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1135  hypothetical protein  33.87 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.616749  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2676  hypothetical protein  30.53 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000868105  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5514  hypothetical protein  39.39 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63320  hypothetical protein  38.79 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4587  lipoprotein  35.96 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0469  hypothetical protein  28.49 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3174  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00025899  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1347  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000908641  hitchhiker  0.0000000000414512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3016  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3031  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3343  hypothetical protein  31.55 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1273  hypothetical protein  31.02 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000675373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1202  hypothetical protein  31.02 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0005069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2678  hypothetical protein  31.55 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.019239  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1006  hypothetical protein  28.98 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.230842 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1203  hypothetical protein  30.48 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.063894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1147  hypothetical protein  29.79 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00658881  normal  0.0364761 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1947  putative lipoprotein  32.1 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0577  hypothetical protein  32.26 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.603488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0616  hypothetical protein  32.26 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1528  hypothetical protein  30.39 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0622  hypothetical protein  31.94 
 
 		 211 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0113849 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1478  hypothetical protein  31.55 
 
 		 189 aa  70.9  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.840474  normal  0.345122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0640  putative lipoprotein  30.84 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.508137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3290  hypothetical protein  28.34 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000451719  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07250  lipoprotein  32.12 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1907  hypothetical protein  30.11 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905779  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000348  hypothetical protein  28.72 
 
 		 172 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1101  hypothetical protein  28.88 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000221835  normal  0.0488625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1068  hypothetical protein  28.88 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000510345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0634  putative lipoprotein  34.63 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6525  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1660  hypothetical protein  27.22 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.715972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0739  hypothetical protein  31.18 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0999  hypothetical protein  28.34 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998217  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06158  hypothetical protein  28.49 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1146  hypothetical protein  25.64 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0739  lipoprotein, putative  29.76 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1007  hypothetical protein  29.94 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613639  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00590  putative lipoprotein  29.44 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.966617  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4152  putative lipoprotein  26.29 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0893  hypothetical protein  29.26 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000267629  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3161  hypothetical protein  23.91 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6323  putative lipoprotein  22.73 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1595  hypothetical protein  26.42 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0515991  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2803  hypothetical protein  27.84 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.316903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1605  hypothetical protein  26.77 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0978  hypothetical protein  26.01 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2866  hypothetical protein  25.65 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3090  hypothetical protein  26.63 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00239332  normal  0.428293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0498  putative lipoprotein  26.06 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3009  hypothetical protein  26.18 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  normal  0.0687233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1027  hypothetical protein  29.35 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000130627  normal  0.110707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4076  hypothetical protein  27.22 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3597  hypothetical protein  27.47 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05585  hypothetical protein  27.72 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3187  hypothetical protein  25.65 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00707615  normal  0.59429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0959  hypothetical protein  29.41 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000203172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0406  putative lipoprotein  25.45 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0934  hypothetical protein  25.28 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00940  hypothetical protein  26.58 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1444  putative lipoprotein  27.01 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0676228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2105  hypothetical protein  33.71 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3371  hypothetical protein  28.57 
 
 		 179 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1107  hypothetical protein  21.93 
 
 		 184 aa  41.2  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>