154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0568 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  310  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  96.03 
 
 		 151 aa  280  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  76.16 
 
 		 151 aa  243  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  75.5 
 
 		 151 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  63.7 
 
 		 151 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  60.69 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  60.93 
 
 		 151 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  55.63 
 
 		 151 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  57.62 
 
 		 151 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  62.02 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  55.92 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  47.62 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  45.45 
 
 		 152 aa  153  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  50.68 
 
 		 150 aa  146  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  45.33 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  52.78 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  41.67 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  42.07 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  44.14 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  44.52 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  43.36 
 
 		 163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  44.29 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16060  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  34.72 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02923  hypothetical protein  32.84 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  26.87 
 
 		 312 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  28.08 
 
 		 187 aa  57  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3016  hypothetical protein  26.72 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02732  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.979452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0793  hypothetical protein  25.19 
 
 		 314 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1356  hypothetical protein  27.41 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.895893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  24.06 
 
 		 323 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  26.32 
 
 		 322 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  28.35 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  27.66 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  27.54 
 
 		 224 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  25.78 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  31.94 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  31.51 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  30.22 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  23.31 
 
 		 241 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  24.65 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  25.84 
 
 		 315 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  35.24 
 
 		 1372 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1084  transposase and inactivated derivatives  23.44 
 
 		 338 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0844  hypothetical protein  27.07 
 
 		 340 aa  51.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  33.33 
 
 		 1345 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  29.41 
 
 		 282 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  26.52 
 
 		 216 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  27.74 
 
 		 191 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  26.71 
 
 		 205 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05745  hypothetical protein  55.26 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.948839  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  25.85 
 
 		 169 aa  50.4  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1966  hypothetical protein  29.41 
 
 		 305 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.527692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  26.04 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  24.7 
 
 		 223 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  26.62 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  25.45 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  29.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  23.13 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  29.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  24.37 
 
 		 236 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3020  hypothetical protein  23.66 
 
 		 316 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  29.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  28.38 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3105  protein of unknown function DUF1568  26.21 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000625853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  23.08 
 
 		 221 aa  48.9  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3078  protein of unknown function DUF1568  26.21 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0770  protein of unknown function DUF1568  25.58 
 
 		 316 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 		 304 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  26.76 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1782  protein of unknown function DUF1568  23.02 
 
 		 325 aa  47.4  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0188832 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2643  transposase domain-containing protein  22.46 
 
 		 335 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0300  hypothetical protein  24.42 
 
 		 193 aa  47.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.401229  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2192  hypothetical protein  25.18 
 
 		 253 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  27.82 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  24.37 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  28.08 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  27.14 
 
 		 239 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  25.52 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  24.46 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2771  hypothetical protein  26.09 
 
 		 318 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  31.87 
 
 		 230 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2207  protein of unknown function DUF1568  31.87 
 
 		 323 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.45311e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  29.81 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0793  hypothetical protein  31.68 
 
 		 335 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000261863  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0925  protein of unknown function DUF1568  24.03 
 
 		 336 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  31.87 
 
 		 230 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  32.97 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0324  protein of unknown function DUF1568  29.07 
 
 		 252 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.551772  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1724  hypothetical protein  27.91 
 
 		 248 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1725  hypothetical protein  27.91 
 
 		 248 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1966  hypothetical protein  29.66 
 
 		 231 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.74185  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  27.27 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2239  hypothetical protein  23.37 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.892224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  23.72 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  23.94 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>