32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0537 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0537  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0576  hypothetical protein  96.57 
 
 		 233 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.664353  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0582  transcriptional regulator  87.98 
 
 		 233 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.794333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0589  transcriptional regulator  68.1 
 
 		 233 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0623  peptidase S24, S26A and S26B  42.26 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.471102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0721  transcriptional regulator, putative  42.19 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  32 
 
 		 256 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  30.5 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  27.85 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  27 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  30.7 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  32.19 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  26.5 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2622  putative phage repressor  26.36 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000146435 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  31.51 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  32.19 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  24.37 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  33.03 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  28.08 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  28.08 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  29.45 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1135  phage repressor  31.58 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  24.26 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  25.21 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2167  putative phage repressor  24.75 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.117586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4049  putative phage repressor  29.82 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00309972  hitchhiker  0.0000000001929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1875  putative phage repressor  25.48 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  24.16 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  32.35 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>