104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0418 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  100 
 
 
629 aa  1272    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0569  autotransporting lipase, GDSL family  59.72 
 
 
640 aa  748    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4606  Outer membrane autotransporter barrel  58.93 
 
 
640 aa  730    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.310199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  60.42 
 
 
636 aa  731    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  60.77 
 
 
646 aa  757    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  98.09 
 
 
629 aa  1253    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  62.1 
 
 
646 aa  751    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  90.69 
 
 
626 aa  1140    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  88.24 
 
 
629 aa  1124    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2645  outer membrane autotransporter  27.19 
 
 
630 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3188  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.02 
 
 
617 aa  153  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0065  outer membrane autotransporter  27.06 
 
 
662 aa  141  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01843  lipase; esterase  27.5 
 
 
594 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2327  outer membrane autotransporter  24.65 
 
 
628 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.542072 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0877  Outer membrane autotransporter barrel  26.29 
 
 
628 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1985  outer membrane autotransporter  25.34 
 
 
597 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2063  lipase/esterase  24.85 
 
 
597 aa  125  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0616  lipase 1  26.93 
 
 
656 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0682  lipase 1  26.93 
 
 
656 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.668862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0623  lipase 1  26.78 
 
 
656 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0738  lipase 1  26.18 
 
 
584 aa  107  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1186  lipolytic protein  30.86 
 
 
337 aa  92  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.87 
 
 
629 aa  87.4  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0756  Outer membrane autotransporter barrel  26.74 
 
 
647 aa  83.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.745695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  23.48 
 
 
684 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  23.04 
 
 
664 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0319  lipolytic protein G-D-S-L family  31.45 
 
 
329 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0326  lipolytic protein G-D-S-L family  31.45 
 
 
329 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1770  lipolytic protein  27.83 
 
 
319 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.949793  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3183  lipolytic protein  28.4 
 
 
349 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0162266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3239  Phosphatidylcholine--sterol O-acyltransferase  29.28 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579995  normal  0.0847319 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  26.38 
 
 
658 aa  77.8  0.0000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2331  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.53 
 
 
330 aa  73.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.622531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  23.22 
 
 
684 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.49 
 
 
641 aa  70.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  24.23 
 
 
723 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  31.37 
 
 
488 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.3 
 
 
418 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.62 
 
 
774 aa  64.7  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  27.97 
 
 
759 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4161  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  22.81 
 
 
607 aa  62.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.930949  normal  0.682493 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0299  putative lipase / esterase protein  26.82 
 
 
353 aa  60.8  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0104  GDSL family lipase  27.13 
 
 
268 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  28.02 
 
 
636 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.93 
 
 
3152 aa  58.9  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2264  lysophospholipase A  22.94 
 
 
309 aa  58.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0855  lipolytic protein G-D-S-L family  25.08 
 
 
284 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2291  lysophospholipase A  22.94 
 
 
309 aa  58.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  23.81 
 
 
816 aa  58.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.12 
 
 
2302 aa  57.8  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.12 
 
 
1865 aa  57.8  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.12 
 
 
1842 aa  58.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  27.56 
 
 
1025 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.12 
 
 
3015 aa  57.8  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4565  lipase  25.91 
 
 
316 aa  57.4  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.12 
 
 
1953 aa  57.4  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  23.02 
 
 
1068 aa  57.4  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0580  putative lipase / esterase protein  28.3 
 
 
347 aa  57  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  27.38 
 
 
763 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3285  lipase  23.47 
 
 
317 aa  55.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  28.81 
 
 
637 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  24.55 
 
 
939 aa  54.3  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  32.92 
 
 
985 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3436  PEP motif-containing protein  29.04 
 
 
310 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  29.03 
 
 
1222 aa  53.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  26.63 
 
 
3954 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.48 
 
 
913 aa  52.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  23.13 
 
 
728 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  23.13 
 
 
728 aa  52  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  23.13 
 
 
728 aa  51.6  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  29.61 
 
 
3506 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1704  lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein  25.56 
 
 
341 aa  51.6  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135355  normal  0.0632285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3937  lipase  23.15 
 
 
317 aa  50.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  25.97 
 
 
4238 aa  50.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  25.97 
 
 
4238 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  25.97 
 
 
3822 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.33 
 
 
1227 aa  48.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.67 
 
 
915 aa  47.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0485  lipolytic protein G-D-S-L family  26.73 
 
 
347 aa  47.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1005  lipase  27.16 
 
 
379 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0841  hypothetical protein  27.16 
 
 
379 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.682529  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0846  hypothetical protein  27.16 
 
 
379 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  23.13 
 
 
1677 aa  47.4  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  26.67 
 
 
1119 aa  47.4  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  24.44 
 
 
1012 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0304  hypothetical protein  26.92 
 
 
379 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.882729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0599  hypothetical protein  26.92 
 
 
379 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2433  hypothetical protein  26.92 
 
 
379 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0046  hypothetical protein  26.92 
 
 
379 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.354332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1491  lipolytic protein G-D-S-L family  28.48 
 
 
372 aa  46.6  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.530351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  33.1 
 
 
986 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6375  lipolytic protein  25.81 
 
 
454 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2743  putative lipase/esterase  26.2 
 
 
339 aa  45.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0921024  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  22.37 
 
 
972 aa  45.8  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2640  hypothetical protein  26.82 
 
 
516 aa  45.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2510  hypothetical protein  26.82 
 
 
516 aa  45.1  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0670  hypothetical protein  28.02 
 
 
379 aa  45.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.73 
 
 
1369 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  30.4 
 
 
1056 aa  45.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2717  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.18 
 
 
877 aa  44.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>