258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0321 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  98.84 
 
 
346 aa  716  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  96.52 
 
 
346 aa  697  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  100 
 
 
346 aa  723  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  2.81363e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  98.84 
 
 
346 aa  712  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  85.47 
 
 
346 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  85.84 
 
 
346 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  85.26 
 
 
346 aa  621  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  83.43 
 
 
346 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  2.48279e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  85.8 
 
 
346 aa  613  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  6.54342e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  85.26 
 
 
346 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  72.32 
 
 
346 aa  516  1e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  72.02 
 
 
346 aa  515  1e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  72.02 
 
 
346 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  71.68 
 
 
348 aa  503  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  66.76 
 
 
346 aa  493  1e-138  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  66.57 
 
 
348 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  66.47 
 
 
348 aa  484  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  65.68 
 
 
346 aa  481  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  65.2 
 
 
350 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  65.19 
 
 
351 aa  481  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  64.52 
 
 
355 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  63.56 
 
 
352 aa  478  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  64.31 
 
 
343 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  64.12 
 
 
353 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.48444e-07 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  64.31 
 
 
343 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  63.61 
 
 
347 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  65.1 
 
 
345 aa  469  1e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  66.57 
 
 
348 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  63.72 
 
 
343 aa  458  1e-128  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  63.47 
 
 
349 aa  459  1e-128  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  64.81 
 
 
361 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  64.81 
 
 
371 aa  454  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  64.62 
 
 
353 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  67.35 
 
 
362 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  64.81 
 
 
361 aa  454  1e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  60.78 
 
 
364 aa  438  1e-122  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  51.94 
 
 
350 aa  371  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1430  L-threonine aldolase  55.29 
 
 
350 aa  351  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  45.59 
 
 
340 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  42.23 
 
 
349 aa  288  7e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  44.44 
 
 
346 aa  286  5e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  1.43153e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  43.44 
 
 
349 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  45.29 
 
 
352 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  44.71 
 
 
341 aa  274  1e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  47.18 
 
 
368 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  46.27 
 
 
359 aa  270  3e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  44.25 
 
 
353 aa  268  9e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  45.59 
 
 
339 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  45.81 
 
 
351 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  42.94 
 
 
341 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  43.57 
 
 
375 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  44.78 
 
 
365 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.48071e-08 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  44.78 
 
 
362 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  43.15 
 
 
350 aa  262  7e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.32 
 
 
356 aa  262  7e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  43.79 
 
 
365 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  45.18 
 
 
369 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  40.75 
 
 
375 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  45.96 
 
 
352 aa  254  1e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3267  L-threonine aldolase  41.81 
 
 
338 aa  254  1e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  42.64 
 
 
347 aa  253  5e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1844  threonine aldolase  39.87 
 
 
355 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.95316  normal  0.0155245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  43.92 
 
 
353 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  42.22 
 
 
345 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  42.9 
 
 
357 aa  246  4e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0496  threonine aldolase  42.33 
 
 
336 aa  245  7e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96601  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2302  L-threonine aldolase  43.24 
 
 
341 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  43.57 
 
 
339 aa  242  8e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  41.07 
 
 
351 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  37.97 
 
 
353 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  38.37 
 
 
338 aa  233  4e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  40.59 
 
 
352 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1169  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  43.87 
 
 
353 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  40.99 
 
 
340 aa  228  9e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1813  threonine aldolase  42.57 
 
 
353 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3029  threonine aldolase  42.36 
 
 
357 aa  225  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  41.04 
 
 
350 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  41.99 
 
 
348 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  39.42 
 
 
349 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  41.35 
 
 
358 aa  223  5e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  41.35 
 
 
358 aa  223  5e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2198  threonine aldolase  42.04 
 
 
341 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  39.88 
 
 
349 aa  222  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  41.06 
 
 
358 aa  221  1e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  38.94 
 
 
343 aa  221  1e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3876  Threonine aldolase  43.32 
 
 
350 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.533395 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  41.16 
 
 
374 aa  217  3e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  37.24 
 
 
352 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0112  Threonine aldolase  39.11 
 
 
387 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  40.38 
 
 
350 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2712  threonine aldolase  39.61 
 
 
348 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  33.82 
 
 
344 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  33.43 
 
 
345 aa  164  1e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  31.95 
 
 
350 aa  164  2e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1162  Threonine aldolase  33.24 
 
 
345 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  36.21 
 
 
357 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  31.88 
 
 
342 aa  153  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  32.17 
 
 
339 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04194  threonine aldolase  36.55 
 
 
282 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2181  threonine aldolase  30.61 
 
 
346 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0421215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>