More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0267 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 689 aa  1399    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  92.26 
 
 		 698 aa  1297    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  73.1 
 
 		 700 aa  1045    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  98.4 
 
 		 689 aa  1379    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  49.06 
 
 		 680 aa  627  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  45.03 
 
 		 712 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  45.17 
 
 		 749 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  45.9 
 
 		 656 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  40.03 
 
 		 712 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 707 aa  349  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 770 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  32.59 
 
 		 710 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  32.91 
 
 		 710 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 694 aa  340  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 		 715 aa  337  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1439  TonB-dependent receptor protein  31.74 
 
 		 688 aa  333  4e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 		 719 aa  313  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 792 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 706 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 706 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 757 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 709 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  33.01 
 
 		 703 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  32.99 
 
 		 695 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  32.82 
 
 		 708 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  31.19 
 
 		 860 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 727 aa  290  6e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.1 
 
 		 703 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 701 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  32.64 
 
 		 709 aa  289  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  34.03 
 
 		 703 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 692 aa  281  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.21 
 
 		 696 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 745 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 		 696 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 755 aa  267  5e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 850 aa  264  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 726 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  31.08 
 
 		 726 aa  263  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.16 
 
 		 732 aa  262  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.16 
 
 		 743 aa  261  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 		 724 aa  260  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 732 aa  259  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  28.02 
 
 		 734 aa  259  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  30.79 
 
 		 734 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 837 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 742 aa  250  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  29.51 
 
 		 742 aa  250  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 705 aa  250  7e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 724 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 736 aa  247  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  31.61 
 
 		 719 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.95 
 
 		 817 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  27.77 
 
 		 734 aa  245  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 722 aa  244  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  29.75 
 
 		 825 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 693 aa  244  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  30.83 
 
 		 726 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 689 aa  243  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  31 
 
 		 689 aa  242  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  29.6 
 
 		 825 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  30.26 
 
 		 864 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 708 aa  241  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 859 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 701 aa  238  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 757 aa  236  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 701 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.75 
 
 		 710 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 736 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 701 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 701 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  30.27 
 
 		 741 aa  234  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 		 753 aa  233  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 701 aa  230  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 722 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0716  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 731 aa  228  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000695687  hitchhiker  0.000361428 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  28.17 
 
 		 703 aa  227  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 701 aa  227  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 701 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  26.93 
 
 		 753 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0740  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000168203  hitchhiker  0.000000023146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3635  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 730 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000376942  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 740 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 738 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  29.24 
 
 		 735 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0697  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 731 aa  225  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000103778  hitchhiker  0.00047729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 732 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  29.91 
 
 		 862 aa  224  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0749  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 730 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000266639  hitchhiker  0.000229655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3245  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 731 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000124115  hitchhiker  0.00000616268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0720  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 730 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599666  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  28.77 
 
 		 716 aa  223  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 707 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 724 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 771 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  29.08 
 
 		 713 aa  221  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  28.64 
 
 		 732 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.63 
 
 		 708 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 710 aa  220  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.82 
 
 		 709 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>