More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0231 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 279 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.85 
 
 		 279 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.06 
 
 		 279 aa  487  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.47 
 
 		 279 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  80.63 
 
 		 279 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  83.08 
 
 		 285 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  62.68 
 
 		 279 aa  325  5e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  60.93 
 
 		 284 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  60.93 
 
 		 284 aa  324  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  60.93 
 
 		 284 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  69.13 
 
 		 275 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  65.64 
 
 		 275 aa  306  3e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  65.25 
 
 		 275 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  65.25 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.25 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  65.25 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  65.25 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  64.86 
 
 		 275 aa  301  6.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  64.86 
 
 		 275 aa  301  6.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  65.64 
 
 		 275 aa  295  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  64.32 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  64.89 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  64.89 
 
 		 283 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  64.32 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  64.89 
 
 		 285 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  64.32 
 
 		 283 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  62.14 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  63.01 
 
 		 272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  60.91 
 
 		 282 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  63.41 
 
 		 272 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.45 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0692  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  52.27 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000618741  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.89 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.78 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197989  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.9 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.13 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.085274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.78 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0085  taurine ABC transporter inner membrane protein  50 
 
 		 283 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.135193 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  50.4 
 
 		 330 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.15 
 
 		 306 aa  234  9e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4207  ABC taurine transporter, inner membrane subunit  50 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54 
 
 		 296 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.08 
 
 		 293 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6225  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  49.82 
 
 		 320 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2883  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.29 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2477  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.2 
 
 		 289 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0948255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  51.53 
 
 		 261 aa  224  9e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.34 
 
 		 284 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.63 
 
 		 272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0949532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.68 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.905374 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.17 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.17 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.17 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.49 
 
 		 280 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.32 
 
 		 412 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 		 284 aa  194  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.39 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.02 
 
 		 430 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00472137  normal  0.430362 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.577279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  40.24 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  43.62 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.154719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  38.82 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  38.4 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  35.74 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.5 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.7 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  34.48 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1867  ABC transporter permease  36.55 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.25 
 
 		 277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 		 286 aa  161  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.97 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.32 
 
 		 294 aa  161  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0116  membrane protein  39.92 
 
 		 281 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0935043  hitchhiker  0.000854026 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0833403  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  40.34 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  36.71 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.13 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  36.29 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 		 276 aa  158  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>