55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0139 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0139  putative lipoprotein  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.646492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0157  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  91 
 
 		 211 aa  362  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0155  lipoprotein  91 
 
 		 211 aa  354  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5088  hypothetical protein  82.29 
 
 		 207 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.0631023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0040  putative lipoprotein  62.5 
 
 		 208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236399  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1912  putative lipoprotein  54.5 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22650  putative ABC-type uncharacterized transport system  55.19 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0370  hypothetical protein  51.63 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04750  hypothetical protein  47.72 
 
 		 205 aa  181  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1157  protein of unknown function DUF330  45.37 
 
 		 247 aa  171  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1609  hypothetical protein  40.93 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1842  putative ABC-type uncharacterized transport system  38.5 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0521  protein of unknown function DUF330  34.78 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.67807  normal  0.409639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03180  lipoprotein, putative  29.21 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0576  putative secreted protein  27.84 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0625  hypothetical protein  27.84 
 
 		 213 aa  95.1  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.289104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2001  hypothetical protein  30.46 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1194  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  30.21 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.907024  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2047  hypothetical protein  27.78 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2515  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  27.78 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198377  normal  0.0124768 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1896  hypothetical protein  25.98 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4116  hypothetical protein  26.94 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0330836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  24.21 
 
 		 378 aa  62  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1486  hypothetical protein  31.09 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3567  hypothetical protein  26.04 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.690462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2812  hypothetical protein  31.09 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.882153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  24.18 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1717  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  32.5 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.230459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0989  putative lipoprotein  24.28 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1955  hypothetical protein  25.17 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1022  putative lipoprotein  24.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1551  hypothetical protein  27.89 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0315787  normal  0.155463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2110  lipoprotein  22.68 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.214262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1543  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like  23.94 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0904417  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  27.63 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1502  protein of unknown function DUF330  25.33 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2314  hypothetical protein  25.85 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.21644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  23.31 
 
 		 390 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2804  protein of unknown function DUF330  30.65 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1981  putative ABC transporter protein  24.14 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00566413  normal  0.786267 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2345  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.623027  normal  0.0122599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  29.05 
 
 		 367 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3671  hypothetical protein  26.21 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1678  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  23.35 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  23.33 
 
 		 390 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4964  protein of unknown function DUF330  26.03 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2192  protein of unknown function DUF330  22.41 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0373997  normal  0.146853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0894  hypothetical protein  24.16 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.749992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0854  protein of unknown function DUF330  24.16 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251206  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0820  protein of unknown function DUF330  24.16 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4936  hypothetical protein  26.55 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0099  protein of unknown function DUF330  20.8 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0434  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.731661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2745  ABC-type uncharacterized transport system auxiliary component-like protein  29.55 
 
 		 195 aa  41.6  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.13119 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0615  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>