More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0118 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 257 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  99.22 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  99.22 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  96.5 
 
 		 257 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  84.29 
 
 		 261 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  81.82 
 
 		 264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  82.82 
 
 		 262 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  81.68 
 
 		 262 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  76.21 
 
 		 269 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  75.84 
 
 		 269 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  74.71 
 
 		 257 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  59.13 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  59.13 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  59.13 
 
 		 253 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  60.16 
 
 		 252 aa  301  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  59.75 
 
 		 252 aa  294  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  59.5 
 
 		 252 aa  293  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  55.81 
 
 		 258 aa  293  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  59.5 
 
 		 252 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  59.75 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  59.34 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  59.34 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  59.34 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 		 251 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  59.34 
 
 		 251 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  59.75 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  59.75 
 
 		 251 aa  288  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  59.34 
 
 		 268 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  58.26 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  59.17 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  53.06 
 
 		 258 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  60.26 
 
 		 265 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  54.94 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  52.54 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  54.13 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  56.33 
 
 		 260 aa  258  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 		 298 aa  257  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  54.87 
 
 		 262 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  54.87 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  49.03 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  54.42 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  50.62 
 
 		 301 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  53.98 
 
 		 262 aa  241  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  55.46 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  51.06 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  52.21 
 
 		 243 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  52.21 
 
 		 243 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  49.15 
 
 		 260 aa  231  9e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  52.42 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  52.86 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  48.93 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  48.46 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  50.21 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  47.43 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  45.81 
 
 		 243 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  45.92 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  47.11 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  50 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 		 242 aa  177  1e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  41.26 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  36.7 
 
 		 217 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  37.76 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  38.17 
 
 		 248 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.39 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  42.05 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  42.05 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  40 
 
 		 308 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  35.93 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  37.29 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  37.84 
 
 		 244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  37.78 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  36.91 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  32.35 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  33.46 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  38.98 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  35.97 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  31.62 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  36.82 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  39.34 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  36.82 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  32.59 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  32.53 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  35.34 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  31.54 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  32.58 
 
 		 236 aa  136  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  34.55 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  32.22 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  35.81 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  32.66 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  37.66 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  33.46 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  35.16 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>