29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0087 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0087  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0102  hypothetical protein  97.26 
 
 
73 aa  138  2e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  5.05882e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0102  hypothetical protein  97.26 
 
 
73 aa  138  2e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0105  hypothetical protein  86.3 
 
 
73 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0099  hypothetical protein  74.32 
 
 
74 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0154  hypothetical protein  64.86 
 
 
74 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0038  hypothetical protein  64.86 
 
 
74 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0041  hypothetical protein  62.67 
 
 
75 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00480  hypothetical protein  61.33 
 
 
75 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4456  hypothetical protein  53.33 
 
 
76 aa  79.3  2e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0105  hypothetical protein  49.33 
 
 
77 aa  72  2e-12  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  4.14235e-06 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0151  hypothetical protein  49.33 
 
 
77 aa  72.4  2e-12  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00720  hypothetical protein  51.39 
 
 
77 aa  71.6  3e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0041  hypothetical protein  50.68 
 
 
77 aa  71.2  4e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0090  hypothetical protein  46.15 
 
 
98 aa  71.6  4e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0108  hypothetical protein  48 
 
 
76 aa  69.3  2e-11  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72225  hitchhiker  0.00358532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0060  hypothetical protein  47.14 
 
 
77 aa  68.2  3e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0105  hypothetical protein  45.33 
 
 
77 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01140  hypothetical protein  49.33 
 
 
99 aa  63.2  1e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.147153  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0096  hypothetical protein  41.56 
 
 
79 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3604  hypothetical protein  44.44 
 
 
122 aa  52.8  2e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.476197  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1978  hypothetical protein  43.24 
 
 
81 aa  52.4  2e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1866  putative lipoprotein  43.24 
 
 
81 aa  52.4  2e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.380587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3978  protein of unknown function DUF1161  44.12 
 
 
110 aa  48.9  2e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.234117  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2124  hypothetical protein  37.1 
 
 
140 aa  49.3  2e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2348  protein of unknown function DUF1161  40 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0734587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2047  hypothetical protein  39.19 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.58796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2287  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.581358  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1926  hypothetical protein  32.43 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>