44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0050 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0050  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  277  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000582651 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0066  hypothetical protein  98.52 
 
 		 135 aa  273  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0066  hypothetical protein  93.33 
 
 		 135 aa  263  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0069  integral membrane protein-like protein  70.92 
 
 		 141 aa  203  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.494759  hitchhiker  0.00000146869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1530  hypothetical protein  45.52 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0059  hypothetical protein  45.68 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2431  integral membrane protein-like  37.59 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2225  integral membrane protein-like protein  33.58 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2345  integral membrane protein-like protein  33.58 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0132  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  67  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1214  hypothetical protein  33.83 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0933096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1206  hypothetical protein  33.83 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1052  hypothetical protein  33.83 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0816  hypothetical protein  33.83 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1904  hypothetical protein  33.83 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0992  hypothetical protein  33.58 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.105139  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4581  integral membrane protein-like protein  36.72 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.391176 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2562  putative transmembrane signal peptide protein  30.6 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0712  putative secreted protein  42.62 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1709  putative transmembrane signal peptide protein  27.74 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5648  integral membrane protein-like  33.65 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0972  integral membrane protein-like protein  38.98 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0815  hypothetical protein  44.07 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0832  integral membrane protein  43.33 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2329  integral membrane protein-like protein  37.29 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.586195  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1694  integral membrane protein-like  37.29 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1807  integral membrane protein-like  28.86 
 
 		 153 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105651  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2306  integral membrane protein-like protein  37.29 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1525  hypothetical protein  37.84 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.478461 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2721  hypothetical protein  32.35 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.079444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2386  hypothetical protein  32.53 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2418  hypothetical protein  47.06 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00537  hypothetical protein  36.21 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0791378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3217  hypothetical protein  34.48 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2257  hypothetical protein  38.98 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0471  hypothetical protein  28.91 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0540  hypothetical protein  28.91 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3090  hypothetical protein  35 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.266132 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1550  conserved hypothetical protein  35 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0936  hypothetical protein  35 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1540  hypothetical protein  35 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0572  hypothetical protein  37.5 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2506  lipoprotein, putative  31.58 
 
 		 102 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0591914  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4398  hypothetical protein  32.35 
 
 		 266 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.758309 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>