More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0007 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  98.77 
 
 		 81 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  85.19 
 
 		 81 aa  151  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  83.95 
 
 		 81 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  85.19 
 
 		 81 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  80.25 
 
 		 81 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  80.25 
 
 		 81 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  66.67 
 
 		 97 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  61.25 
 
 		 82 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  53.09 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  55.26 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 		 69 aa  97.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2150  protein of unknown function DUF37  62.32 
 
 		 69 aa  93.6  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  55.71 
 
 		 92 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  55.41 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  55.13 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 		 87 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  55.88 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  62.32 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  61.9 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  51.85 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  51.85 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  55.41 
 
 		 84 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  51.85 
 
 		 88 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  59.42 
 
 		 99 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  52.44 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3100  hypothetical protein  51.85 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.880044  normal  0.0421646 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  59.42 
 
 		 70 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6521  hypothetical protein  51.85 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2140  protein of unknown function DUF37  52.05 
 
 		 79 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0911877 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  57.97 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  51.47 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3216  hypothetical protein  51.85 
 
 		 88 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2522  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0207247  hitchhiker  0.0000330385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  58.21 
 
 		 107 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  47.89 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3155  hypothetical protein  51.85 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  57.33 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  50.72 
 
 		 70 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  57.35 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  51.28 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3987  hypothetical protein  50.67 
 
 		 76 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4465  hypothetical protein  50.67 
 
 		 76 aa  87.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0835633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  52.17 
 
 		 69 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  54.29 
 
 		 101 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 		 85 aa  87  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  59.7 
 
 		 88 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  51.35 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  52.44 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  57.97 
 
 		 80 aa  86.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  54.29 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2240  hypothetical protein  54.29 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  54.29 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3236  hypothetical protein  54.29 
 
 		 89 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256885  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  54.55 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3099  hypothetical protein  54.29 
 
 		 76 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394667 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0092  hypothetical protein  54.29 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3551  hypothetical protein  54.29 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0106  hypothetical protein  54.29 
 
 		 89 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  55.71 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3036  hypothetical protein  53.62 
 
 		 75 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.398787  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3115  hypothetical protein  48.15 
 
 		 105 aa  85.9  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292784  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  56.16 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3728  protein of unknown function DUF37  58.82 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.480542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  50.72 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  52.56 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1754  protein of unknown function DUF37  52.56 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  54.55 
 
 		 73 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  51.39 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 70 aa  84.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1005  protein of unknown function DUF37  56.52 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000006135  normal  0.0352913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  57.81 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  56.25 
 
 		 105 aa  83.6  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  44.87 
 
 		 95 aa  83.6  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  57.38 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  50.7 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3075  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2931  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  51.47 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  50.72 
 
 		 96 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  49.37 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  50.72 
 
 		 98 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  49.28 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  57.58 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  53.62 
 
 		 92 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  54.69 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4359  hypothetical protein  50.72 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0034  protein of unknown function DUF37  56.9 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.908916  normal  0.29812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  52.17 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0033  conserved hypothetical protein TIGR00278  56.9 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.97482  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  49.28 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  50.72 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2672  hypothetical protein  52.94 
 
 		 69 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0684141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  50.72 
 
 		 85 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>