298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1784 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1784  ExsB  100 
 
 
224 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.115928  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19011  ATPase  93.75 
 
 
224 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.422849  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18821  ATPase  92.41 
 
 
224 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.855612  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18821  ATPase  83.86 
 
 
224 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1293  ExsB  60 
 
 
225 aa  284  9e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21651  ATPase  58.49 
 
 
225 aa  281  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.328104 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18241  PP-loop superfamily ATPase  58.99 
 
 
229 aa  279  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2602  ExsB  53.27 
 
 
226 aa  260  1e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.175115  normal  0.073954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29671  ATPase  55.81 
 
 
229 aa  259  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2238  ExsB  50.93 
 
 
226 aa  246  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2002  exsB protein  54.63 
 
 
225 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2027  exsB protein  54.63 
 
 
225 aa  238  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.769285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1877  exsB protein  51.66 
 
 
222 aa  230  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4716  exsB protein  50.71 
 
 
224 aa  225  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.56017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1317  exsB protein  51.71 
 
 
230 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1333  ExsB  50 
 
 
231 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2525  ExsB protein  47.91 
 
 
225 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.228651  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5203  exsB protein  52.53 
 
 
229 aa  221  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3105  exsB protein  50.72 
 
 
222 aa  218  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2362  ExsB  53.08 
 
 
227 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000048435  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4192  exsB protein  46.05 
 
 
228 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0657  exsB protein  54.9 
 
 
237 aa  214  8e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51670  hypothetical protein  47.66 
 
 
224 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000703334  hitchhiker  0.000657127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3989  exsB protein  46.76 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1226  exsB protein  46.05 
 
 
224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4398  ExsB  47.22 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0901  ExsB  46.7 
 
 
232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000228539  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1255  exsB protein  46.05 
 
 
224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4532  hypothetical protein  47.2 
 
 
224 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3217  exsB protein  47.32 
 
 
233 aa  210  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000808637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2372  exsB protein  46.89 
 
 
227 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2179  queuosine biosynthesis protein  46.95 
 
 
244 aa  208  7e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1281  exsB protein  45.58 
 
 
224 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.691809  normal  0.984121 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2202  queuosine biosynthesis protein QueC  46.95 
 
 
226 aa  206  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.887956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2710  ExsB  47.85 
 
 
232 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4042  ExsB  47.87 
 
 
225 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0731  exsB protein  46.7 
 
 
224 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.372152  normal  0.140663 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2225  ExsB ATPase  45.83 
 
 
229 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3968  exsB protein  45.37 
 
 
226 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193691  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2799  hypothetical protein  48.11 
 
 
228 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0436  exsB protein  48.58 
 
 
228 aa  202  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0043011  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0687  exsB protein  46.23 
 
 
224 aa  202  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.877386  normal  0.37979 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2945  hypothetical protein  48.11 
 
 
228 aa  201  7e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3942  exsB protein  45.21 
 
 
234 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0108234  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1233  exsB protein  46.48 
 
 
223 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.583286  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0738  putative signal peptide protein  46.23 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.593438  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0149  ExsB  47.6 
 
 
224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  45.24 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3856  exsB protein  44.75 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  45.24 
 
 
229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0798  ExsB  45.07 
 
 
226 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.126082  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2335  ExsB  46.23 
 
 
229 aa  199  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000753404  normal  0.063598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1419  ExsB  44.44 
 
 
229 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0570  exsB protein  44.71 
 
 
227 aa  198  7e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.087272  normal  0.978313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2672  ExsB  45.07 
 
 
227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00821244  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3799  ExsB protein  44.29 
 
 
234 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.079011  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0539  exsB protein  47.37 
 
 
235 aa  194  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.268202  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1957  ExsB  45.79 
 
 
241 aa  194  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115438  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3788  exsB protein  48.08 
 
 
225 aa  193  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3693  exsB protein  48.08 
 
 
225 aa  194  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1766  exsB protein  46.15 
 
 
256 aa  193  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.43675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1404  exsB protein  46.48 
 
 
230 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.900241  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36600  ExsB protein  45.33 
 
 
224 aa  192  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0272  exsB protein  42.99 
 
 
246 aa  191  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.281019  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0777  ExsB  44.25 
 
 
259 aa  191  6e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0771  ExsB family transcriptional regulator  44.25 
 
 
285 aa  191  7e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.698325 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0496  exsB protein  44.24 
 
 
228 aa  190  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4046  exsB protein  49.04 
 
 
228 aa  190  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.346738  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4380  exsB protein  44.7 
 
 
229 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1355  ExsB  44.91 
 
 
227 aa  187  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.748  normal  0.236246 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1107  transcriptional regulator  45.02 
 
 
230 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000696721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1942  exsB protein  45.07 
 
 
244 aa  185  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.243954  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0998  exsB protein  45.02 
 
 
230 aa  185  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.519707  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3137  ExsB  42.66 
 
 
233 aa  184  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.129626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3115  exsB protein  45.07 
 
 
221 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543639  normal  0.482984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3919  exsB protein  42.13 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.299294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3633  exsB protein  42.92 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1207  exsB protein  46.63 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000226628  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2202  ExsB ATPase  44.23 
 
 
224 aa  181  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000761719 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0284  exsB protein  46.23 
 
 
221 aa  181  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.106122 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1288  exsB protein  45.12 
 
 
226 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0778  exsB protein  42.58 
 
 
233 aa  181  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0837862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3075  ExsB  45.45 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0520876  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3379  ExsB  41.78 
 
 
236 aa  179  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.108829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1984  exsB protein  43.12 
 
 
234 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01572  ExsB protein  43.13 
 
 
224 aa  175  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.779183  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2833  ExsB  45.24 
 
 
220 aa  174  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.106215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0483  exsB protein  44.7 
 
 
237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2982  putative transcriptional regulator  44.98 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1170  exsB protein  39.63 
 
 
484 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2342  exsB protein  37.79 
 
 
251 aa  161  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2210  exsB protein  40.65 
 
 
222 aa  160  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0744  ExsB protein  42.11 
 
 
220 aa  160  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0300  exsB protein  45.24 
 
 
208 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.495784  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1393  exsB protein  36.32 
 
 
243 aa  156  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3059  exsB protein  37.21 
 
 
229 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2885  exsB protein  37.09 
 
 
218 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1355  exsB protein  36.36 
 
 
222 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618958  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1935  exsB protein  40.48 
 
 
226 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0697931  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0728  transcriptional regulator, ExsB family  40.47 
 
 
221 aa  153  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000232803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>