More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1765 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  100 
 
 
151 aa  303  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  98.68 
 
 
151 aa  300  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  96.69 
 
 
151 aa  294  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  84.11 
 
 
151 aa  266  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28961  50S ribosomal protein L9  70.86 
 
 
152 aa  223  9e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2193  50S ribosomal protein L9  69.54 
 
 
152 aa  217  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18001  50S ribosomal protein L9  67.55 
 
 
152 aa  216  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2542  50S ribosomal protein L9  69.13 
 
 
152 aa  216  8.999999999999998e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21431  50S ribosomal protein L9  70.59 
 
 
152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1272  50S ribosomal protein L9  69.93 
 
 
152 aa  214  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2559  50S ribosomal protein L9  58.28 
 
 
152 aa  178  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3244  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 
152 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  55.7 
 
 
152 aa  170  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2852  50S ribosomal protein L9  55.03 
 
 
152 aa  170  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0329  50S ribosomal protein L9  52.32 
 
 
152 aa  152  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355323  normal  0.434143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2897  50S ribosomal protein L9  52.32 
 
 
152 aa  150  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000174347  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1460  50S ribosomal protein L9  52.32 
 
 
152 aa  151  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0890745  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0287  ribosomal protein L9  49.67 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0120134  normal  0.0123082 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  42.18 
 
 
146 aa  111  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
148 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  39.73 
 
 
159 aa  104  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  39.87 
 
 
148 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
147 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29830  Plastid ribosomal protein L9, imported to chloroplast, large ribosomal subunit  39.19 
 
 
195 aa  100  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  38.82 
 
 
150 aa  100  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
148 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
150 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  39.07 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
147 aa  98.6  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
148 aa  97.4  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  38.78 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  34.25 
 
 
147 aa  97.4  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  37.41 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  42.11 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  37.25 
 
 
148 aa  94.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
171 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  36.3 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  39.74 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  40.82 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  36.55 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  38.1 
 
 
151 aa  94  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1780  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  39.31 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1808  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.432428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  39.07 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  41.5 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  36.6 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  35.42 
 
 
149 aa  92  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1894  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 
150 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000492255  hitchhiker  0.000000062237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6208  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 
150 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1871  50S ribosomal protein L9  39.22 
 
 
150 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539407  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  35.76 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5171  50S ribosomal protein L9  38.56 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
167 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  34.23 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  38.67 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  31.08 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  41.06 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  34.67 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
151 aa  90.1  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
151 aa  88.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 
149 aa  89  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  36.05 
 
 
148 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  34.21 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  35.1 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  33.56 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  34.46 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  36.13 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
151 aa  87.8  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1063  ribosomal protein L9  38.1 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.342712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  35.37 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1403  50S ribosomal protein L9  37.91 
 
 
150 aa  87.4  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 
209 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  34.23 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  36.49 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1814  ribosomal protein L9  36.84 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0561  ribosomal protein L9  36.3 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.204129  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  34.69 
 
 
148 aa  85.1  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  33.33 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  33.11 
 
 
149 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  34.69 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>