More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1743 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1743  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  686    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18601  ATPase  87.2 
 
 		 336 aa  604  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.101709  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18411  ATPase  87.5 
 
 		 336 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18411  ATPase  66.37 
 
 		 338 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17771  ATPase  39.22 
 
 		 339 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0884418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00761  ATPase  39.71 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.247507 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1249  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.32 
 
 		 326 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21191  ATPase  40.69 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0074  MesJ-like protein  40.93 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0074  MesJ-like protein  32.84 
 
 		 337 aa  243  5e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  31.63 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.77 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.55 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.11 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  31.17 
 
 		 342 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.47 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.52 
 
 		 324 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3251  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.82 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.04 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.070597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.27 
 
 		 464 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1051  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.18 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.51 
 
 		 454 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  31.43 
 
 		 476 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  31.43 
 
 		 476 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  31.43 
 
 		 476 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.43 
 
 		 476 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1551  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.17 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000725449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.04 
 
 		 509 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1179  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.16 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1464  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.16 
 
 		 464 aa  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.727377  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  31.45 
 
 		 476 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.26 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.05 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.48 
 
 		 464 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  30.74 
 
 		 476 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.26 
 
 		 476 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0441  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.08 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.84 
 
 		 476 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  31.85 
 
 		 476 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.85 
 
 		 476 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0541  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.93 
 
 		 336 aa  99.8  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41194  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2138  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.66 
 
 		 436 aa  99  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87877  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1746  MesJ protein  25.84 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  30.29 
 
 		 455 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0158  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.73 
 
 		 457 aa  97.8  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0865096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.93 
 
 		 456 aa  97.4  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.45 
 
 		 476 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  29.96 
 
 		 470 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.94 
 
 		 472 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.45 
 
 		 476 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0626  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.92 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.31 
 
 		 480 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0704  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.15 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1692  tRNA(Ile)-lysidine synthase  30.36 
 
 		 449 aa  93.2  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.77 
 
 		 339 aa  93.2  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.88 
 
 		 469 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0475  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.36 
 
 		 449 aa  92.8  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4748  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.31 
 
 		 333 aa  92.4  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  29.68 
 
 		 454 aa  92  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000839704 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.65 
 
 		 524 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.75 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.31 
 
 		 442 aa  90.9  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1609  MesJ protein  27.31 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2960  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.48 
 
 		 460 aa  90.1  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0579  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.75 
 
 		 325 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.391449  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  26.91 
 
 		 458 aa  89.4  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144135  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0631  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.9 
 
 		 397 aa  88.6  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.16 
 
 		 469 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.29 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.57 
 
 		 468 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2410  tRNA(Ile)-lysidine synthase  29.41 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.19 
 
 		 455 aa  87.8  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.28 
 
 		 486 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0589  cell cycle protein MesJ  27.05 
 
 		 445 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0620316  normal  0.254248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1163  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.11 
 
 		 427 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114234  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.69 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4169  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.46 
 
 		 427 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.911807 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0977  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.08 
 
 		 438 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1556  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.82 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.63 
 
 		 419 aa  87  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.35 
 
 		 471 aa  86.7  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1289  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.15 
 
 		 436 aa  87  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0934  cell-cycle protein  28.79 
 
 		 427 aa  87  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.504247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.25 
 
 		 333 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.04 
 
 		 521 aa  86.7  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  25.68 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1608  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.01 
 
 		 427 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31 
 
 		 442 aa  85.9  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0207  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.77 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.716943  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1341  hypothetical protein  32.85 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.181704  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1572  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.33 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.685949  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2711  tRNA(Ile)-lysidine synthase  29.02 
 
 		 371 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.658001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.27 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3762  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.76 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0801202  hitchhiker  0.00083153 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  26.47 
 
 		 682 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.57 
 
 		 481 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4968  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.05 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.295349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.07 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1620  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.1 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  28.63 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>