More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1732 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_9327  nuclear-encoded-like protein of plastid sec  42.84 
 
 
935 aa  721    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17671  preprotein translocase subunit SecA  78.47 
 
 
945 aa  1541    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18281  preprotein translocase subunit SecA  87.27 
 
 
943 aa  1715    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.704618  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1077  preprotein translocase subunit SecA  67.27 
 
 
935 aa  1291    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36933  predicted protein  54.42 
 
 
932 aa  1038    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00575996  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18301  preprotein translocase subunit SecA  92.15 
 
 
943 aa  1772    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1220  preprotein translocase subunit SecA  75.13 
 
 
942 aa  1444    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0984174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2124  preprotein translocase subunit SecA  68.23 
 
 
930 aa  1335    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0123  preprotein translocase subunit SecA  77.98 
 
 
937 aa  1524    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0081  preprotein translocase subunit SecA  78.83 
 
 
934 aa  1551    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1732  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 
943 aa  1943    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0289  preprotein translocase subunit SecA  70.43 
 
 
948 aa  1351    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  47.14 
 
 
1067 aa  701    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1106  preprotein translocase subunit SecA  67.27 
 
 
935 aa  1290    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3269  preprotein translocase subunit SecA  68.51 
 
 
930 aa  1333    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.659799  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01511  preprotein translocase subunit SecA  78.68 
 
 
951 aa  1508    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0032  preprotein translocase subunit SecA  67.59 
 
 
935 aa  1311    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20951  preprotein translocase subunit SecA  76.11 
 
 
944 aa  1469    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.396844  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4635  preprotein translocase subunit SecA  68.23 
 
 
936 aa  1334    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.226506  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2105  cyclic nucleotide-binding protein  45.03 
 
 
1007 aa  749    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.877046 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  44.39 
 
 
980 aa  728    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  47.45 
 
 
958 aa  834    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18491  preprotein translocase subunit SecA  92.15 
 
 
943 aa  1785    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3658  preprotein translocase subunit SecA  67.77 
 
 
932 aa  1306    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  47.35 
 
 
957 aa  832    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05460  protein translocase subunit secA  41.76 
 
 
945 aa  647    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  57.92 
 
 
894 aa  612  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  57.66 
 
 
899 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  57.28 
 
 
897 aa  601  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  56.78 
 
 
888 aa  598  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1457  preprotein translocase subunit SecA  56.04 
 
 
912 aa  597  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.34304  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49779  predicted protein  37.97 
 
 
918 aa  590  1e-167  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.894811  normal  0.0907147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2855  protein translocase subunit secA  56.58 
 
 
993 aa  592  1e-167  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  56.74 
 
 
896 aa  586  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  55.95 
 
 
896 aa  586  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  56.62 
 
 
873 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  56.81 
 
 
903 aa  582  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1759  preprotein translocase subunit SecA  56.93 
 
 
1009 aa  582  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  53.55 
 
 
992 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  54.63 
 
 
899 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  55.25 
 
 
931 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  55.43 
 
 
932 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30890  preprotein translocase subunit SecA  37.41 
 
 
955 aa  575  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164673  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  55.06 
 
 
931 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  55.25 
 
 
931 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  55.06 
 
 
931 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  55.06 
 
 
931 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  55.06 
 
 
931 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  55.1 
 
 
886 aa  570  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  55.16 
 
 
924 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  56.59 
 
 
845 aa  569  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  55.06 
 
 
931 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  55.25 
 
 
932 aa  572  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  55.25 
 
 
930 aa  572  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  54.88 
 
 
936 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  54.2 
 
 
936 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  54.56 
 
 
866 aa  570  1e-161  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  55.06 
 
 
932 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  55.06 
 
 
931 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  55.06 
 
 
932 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  54.31 
 
 
910 aa  572  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  55.06 
 
 
932 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  55.06 
 
 
931 aa  572  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  53.32 
 
 
897 aa  566  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  56.14 
 
 
896 aa  567  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  54.91 
 
 
872 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  57.37 
 
 
834 aa  566  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4035  preprotein translocase, SecA subunit  55.05 
 
 
954 aa  568  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  55.53 
 
 
936 aa  568  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  54.03 
 
 
934 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  52.76 
 
 
899 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  55.3 
 
 
910 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  53.83 
 
 
962 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  54.97 
 
 
930 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  54.36 
 
 
934 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  54.86 
 
 
833 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  57 
 
 
796 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  55.43 
 
 
917 aa  560  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6305  preprotein translocase subunit SecA  53.89 
 
 
975 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507355  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  55.07 
 
 
908 aa  559  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  54.06 
 
 
918 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2490  preprotein translocase subunit SecA  54.73 
 
 
968 aa  558  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.801958  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  53.51 
 
 
921 aa  558  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  53.45 
 
 
962 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  56.37 
 
 
901 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  53.45 
 
 
962 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  54.89 
 
 
848 aa  557  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  53.47 
 
 
934 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2325  preprotein translocase, SecA subunit  55.29 
 
 
933 aa  555  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0666996  hitchhiker  0.0000117576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  53.11 
 
 
864 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0767  preprotein translocase subunit SecA  54.65 
 
 
994 aa  554  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.42226  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  53.31 
 
 
838 aa  553  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  56.7 
 
 
859 aa  555  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  53.98 
 
 
844 aa  555  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5838  preprotein translocase subunit SecA  53.7 
 
 
1018 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198512  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  54.48 
 
 
903 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  54.3 
 
 
908 aa  551  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  54.37 
 
 
909 aa  552  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1817  preprotein translocase subunit SecA  53.56 
 
 
911 aa  550  1e-155  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.513906  normal  0.0849834 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  54.6 
 
 
912 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>