40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1685 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1685  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  100 
 
 
236 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.399665  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18021  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  91.91 
 
 
236 aa  447  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.242937  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17851  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  91.91 
 
 
236 aa  444  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.399426  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17801  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  77.16 
 
 
236 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1168  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  43.28 
 
 
238 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.561084  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20431  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  43.28 
 
 
238 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22431  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  37.61 
 
 
249 aa  201  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17141  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  41.05 
 
 
238 aa  194  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.695365  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1906  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  36.02 
 
 
235 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.176317  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0423  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  35.19 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.544521  normal  0.0602885 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4517  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  32.76 
 
 
246 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.991072  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5728  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  33.19 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5051  dihydrobiliverdin:ferredoxin oxidoreductase  34.91 
 
 
244 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.453825 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10830  predicted protein  37.5 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33770  predicted protein  29.56 
 
 
381 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4518  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  29.41 
 
 
247 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5729  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  28.63 
 
 
245 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5050  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.53 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15568  predicted protein  25.21 
 
 
322 aa  77  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1167  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.36 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20421  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.36 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17131  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  28.79 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.93922 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22441  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.11 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0422  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.4392  normal  0.0295083 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45446  predicted protein  26.37 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.505627  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1907  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  25.75 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1724  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  23.62 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1748  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  23.62 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17791  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  31.03 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.600264  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1047  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.52 
 
 
245 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4845  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  19.5 
 
 
259 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1684  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  27.09 
 
 
253 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0093  ferredoxin-dependent bilin reductase  21.27 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18011  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  26.4 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0919498  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4156  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  22.64 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17841  phycoerythrobilin:ferredoxin oxidoreductase  26.4 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.373493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3585  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  19 
 
 
245 aa  45.8  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.561892  normal  0.0200749 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31381  predicted protein  18.52 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1225  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  19.9 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.441578 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1216  phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase  21.94 
 
 
247 aa  42.4  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.261632  normal  0.953756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>