More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1649 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  94.76 
 
 		 210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  94.29 
 
 		 210 aa  403  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  91.43 
 
 		 210 aa  393  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  73.33 
 
 		 212 aa  320  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1128  50S ribosomal protein L4  72.86 
 
 		 211 aa  318  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  70.19 
 
 		 211 aa  306  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0375  50S ribosomal protein L4  68.27 
 
 		 211 aa  305  3e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  70.5 
 
 		 211 aa  304  8.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1956  50S ribosomal protein L4  66.83 
 
 		 211 aa  298  5e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  57.92 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  59.5 
 
 		 210 aa  251  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  56 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  55.22 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  55.22 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  55.98 
 
 		 210 aa  230  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  56.5 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  52.97 
 
 		 212 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40690  Plastid ribosomal protein L4 large ribosomal subunit  46.83 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  41.63 
 
 		 208 aa  174  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  43.13 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  44 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  43.5 
 
 		 204 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  45.45 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  43.06 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  42.18 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  42.58 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  41.23 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  41.63 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  41.71 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  42.11 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  43 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  46.02 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  45.63 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  41.23 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  43.13 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  41.82 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  41.63 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  40.28 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  41.71 
 
 		 207 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  41.63 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  41.35 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  40.57 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  41.71 
 
 		 207 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  44.79 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  41.15 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  41.29 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2658  ribosomal protein L4/L1e  43.63 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29730  LSU ribosomal protein L4P  42.16 
 
 		 234 aa  150  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.379343 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0628  ribosomal protein L4/L1e  43.28 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  42.72 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  40.29 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  40.29 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  43.75 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  43.27 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  41.67 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  37.8 
 
 		 207 aa  147  8e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  40.49 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  39.23 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  42.03 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  40.98 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  38.76 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  42.27 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  41.38 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  41.15 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  40.76 
 
 		 216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  39.61 
 
 		 223 aa  144  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  38.68 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  42.11 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  42.13 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  40.98 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  40.19 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  38.57 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  38.39 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  37.38 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  37.5 
 
 		 207 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  40.69 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  40.09 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0227  50S ribosomal protein L4  39.9 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  39.23 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0490  50S ribosomal protein L4  40 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.789827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>