More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1635 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  95.9 
 
 		 122 aa  238  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  94.26 
 
 		 122 aa  236  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  82.79 
 
 		 122 aa  209  7e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  72.13 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  70.49 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  70.49 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  67.21 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  67.21 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  70.49 
 
 		 122 aa  163  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  65 
 
 		 120 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  65 
 
 		 120 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  60.83 
 
 		 120 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  150  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  60.66 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 120 aa  147  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  146  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  59.09 
 
 		 122 aa  138  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  63.81 
 
 		 120 aa  137  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  64.15 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  59.82 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  59.82 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  58.93 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  58.12 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  60.38 
 
 		 120 aa  129  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  54.84 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  53.28 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  51.64 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  51.35 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  59.43 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  53.23 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  54.47 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  50.82 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  48.78 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  53.15 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1402  ribosomal protein L18  52.21 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  46.34 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  53.28 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  52.25 
 
 		 123 aa  121  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  60.42 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  58.04 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  55.83 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 118 aa  120  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  61.46 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  55.36 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  52.25 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  52.25 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1145  ribosomal protein L18  55.45 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000549459  normal  0.0107289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  47.97 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  49.18 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  54.9 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  50 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  57.29 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  60.42 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  52.25 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  49.11 
 
 		 120 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  52.68 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  57.43 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  47.79 
 
 		 123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2202  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0988305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  50.39 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>